Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVF5

KCTD4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD4Q8WVF5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
KCTD4Q8WVF5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCTD4Q8WVF5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCTD4Q8WVF5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCTD4Q8WVF5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCTD4Q8WVF5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCTD4Q8WVF5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCTD4Q8WVF5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCTD4Q8WVF5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCTD4Q8WVF5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCTD4Q8WVF5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCTD4Q8WVF5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCTD4Q8WVF5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCTD4Q8WVF5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCTD4Q8WVF5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCTD4Q8WVF5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCTD4Q8WVF5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCTD4Q8WVF5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCTD4Q8WVF5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCTD4Q8WVF5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCTD4Q8WVF5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCTD4Q8WVF5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCTD4Q8WVF5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCTD4Q8WVF5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCTD4Q8WVF5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KCTD4Q8WVF5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCTD4Q8WVF5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
KCTD4Q8WVF5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCTD4Q8WVF5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCTD4Q8WVF5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCTD4Q8WVF5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCTD4Q8WVF5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCTD4Q8WVF5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCTD4Q8WVF5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCTD4Q8WVF5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCTD4Q8WVF5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
KCTD4Q8WVF5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCTD4Q8WVF5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCTD4Q8WVF5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCTD4Q8WVF5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCTD4Q8WVF5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCTD4Q8WVF5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCTD4Q8WVF5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCTD4Q8WVF5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCTD4Q8WVF5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCTD4Q8WVF5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCTD4Q8WVF5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCTD4Q8WVF5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KCTD4Q8WVF5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCTD4Q8WVF5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCTD4Q8WVF5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCTD4Q8WVF5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KCTD4Q8WVF5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCTD4Q8WVF5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCTD4Q8WVF5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCTD4Q8WVF5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KCTD4Q8WVF5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCTD4Q8WVF5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCTD4Q8WVF5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCTD4Q8WVF5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCTD4Q8WVF5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KCTD4Q8WVF5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KCTD4Q8WVF5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCTD4Q8WVF5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCTD4Q8WVF5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCTD4Q8WVF5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KCTD4Q8WVF5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCTD4Q8WVF5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCTD4Q8WVF5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KCTD4Q8WVF5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCTD4Q8WVF5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KCTD4Q8WVF5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCTD4Q8WVF5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KCTD4Q8WVF5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCTD4Q8WVF5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KCTD4Q8WVF5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCTD4Q8WVF5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCTD4Q8WVF5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
KCTD4Q8WVF5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KCTD4Q8WVF5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KCTD4Q8WVF5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KCTD4Q8WVF5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KCTD4Q8WVF5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KCTD4Q8WVF5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCTD4Q8WVF5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCTD4Q8WVF5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCTD4Q8WVF5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCTD4Q8WVF5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCTD4Q8WVF5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCTD4Q8WVF5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KCTD4Q8WVF5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCTD4Q8WVF5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCTD4Q8WVF5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCTD4Q8WVF5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCTD4Q8WVF5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCTD4Q8WVF5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCTD4Q8WVF5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KCTD4Q8WVF5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KCTD4Q8WVF5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KCTD4Q8WVF5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms