Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUM4

PDCD6IP, Programmed cell death 6-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD6IPQ8WUM4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCD6IPQ8WUM4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCD6IPQ8WUM4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCD6IPQ8WUM4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCD6IPQ8WUM4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCD6IPQ8WUM4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCD6IPQ8WUM4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCD6IPQ8WUM4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCD6IPQ8WUM4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCD6IPQ8WUM4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCD6IPQ8WUM4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCD6IPQ8WUM4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCD6IPQ8WUM4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCD6IPQ8WUM4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCD6IPQ8WUM4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCD6IPQ8WUM4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCD6IPQ8WUM4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCD6IPQ8WUM4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCD6IPQ8WUM4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCD6IPQ8WUM4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCD6IPQ8WUM4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCD6IPQ8WUM4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCD6IPQ8WUM4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCD6IPQ8WUM4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCD6IPQ8WUM4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCD6IPQ8WUM4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCD6IPQ8WUM4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCD6IPQ8WUM4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCD6IPQ8WUM4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCD6IPQ8WUM4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCD6IPQ8WUM4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCD6IPQ8WUM4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCD6IPQ8WUM4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCD6IPQ8WUM4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCD6IPQ8WUM4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PDCD6IPQ8WUM4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PDCD6IPQ8WUM4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCD6IPQ8WUM4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCD6IPQ8WUM4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCD6IPQ8WUM4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCD6IPQ8WUM4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCD6IPQ8WUM4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCD6IPQ8WUM4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCD6IPQ8WUM4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCD6IPQ8WUM4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCD6IPQ8WUM4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDCD6IPQ8WUM4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCD6IPQ8WUM4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCD6IPQ8WUM4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCD6IPQ8WUM4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCD6IPQ8WUM4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCD6IPQ8WUM4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCD6IPQ8WUM4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCD6IPQ8WUM4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCD6IPQ8WUM4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCD6IPQ8WUM4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCD6IPQ8WUM4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCD6IPQ8WUM4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCD6IPQ8WUM4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCD6IPQ8WUM4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCD6IPQ8WUM4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCD6IPQ8WUM4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCD6IPQ8WUM4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCD6IPQ8WUM4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCD6IPQ8WUM4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCD6IPQ8WUM4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCD6IPQ8WUM4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCD6IPQ8WUM4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCD6IPQ8WUM4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCD6IPQ8WUM4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCD6IPQ8WUM4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDCD6IPQ8WUM4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCD6IPQ8WUM4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCD6IPQ8WUM4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCD6IPQ8WUM4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCD6IPQ8WUM4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCD6IPQ8WUM4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCD6IPQ8WUM4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDCD6IPQ8WUM4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCD6IPQ8WUM4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCD6IPQ8WUM4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCD6IPQ8WUM4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCD6IPQ8WUM4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDCD6IPQ8WUM4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCD6IPQ8WUM4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCD6IPQ8WUM4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDCD6IPQ8WUM4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCD6IPQ8WUM4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCD6IPQ8WUM4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCD6IPQ8WUM4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDCD6IPQ8WUM4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDCD6IPQ8WUM4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PDCD6IPQ8WUM4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDCD6IPQ8WUM4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCD6IPQ8WUM4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCD6IPQ8WUM4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCD6IPQ8WUM4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCD6IPQ8WUM4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCD6IPQ8WUM4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDCD6IPQ8WUM4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms