Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC12Q8WUD4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC12Q8WUD4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC12Q8WUD4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC12Q8WUD4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC12Q8WUD4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC12Q8WUD4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC12Q8WUD4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC12Q8WUD4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC12Q8WUD4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC12Q8WUD4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC12Q8WUD4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC12Q8WUD4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC12Q8WUD4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC12Q8WUD4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC12Q8WUD4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC12Q8WUD4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC12Q8WUD4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC12Q8WUD4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC12Q8WUD4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC12Q8WUD4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC12Q8WUD4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC12Q8WUD4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC12Q8WUD4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CCDC12Q8WUD4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC12Q8WUD4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC12Q8WUD4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC12Q8WUD4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC12Q8WUD4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC12Q8WUD4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC12Q8WUD4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC12Q8WUD4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC12Q8WUD4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC12Q8WUD4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC12Q8WUD4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC12Q8WUD4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC12Q8WUD4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC12Q8WUD4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC12Q8WUD4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC12Q8WUD4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC12Q8WUD4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC12Q8WUD4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC12Q8WUD4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC12Q8WUD4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC12Q8WUD4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC12Q8WUD4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC12Q8WUD4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC12Q8WUD4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC12Q8WUD4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC12Q8WUD4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC12Q8WUD4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC12Q8WUD4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC12Q8WUD4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC12Q8WUD4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC12Q8WUD4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC12Q8WUD4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC12Q8WUD4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC12Q8WUD4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC12Q8WUD4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC12Q8WUD4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC12Q8WUD4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC12Q8WUD4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC12Q8WUD4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC12Q8WUD4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC12Q8WUD4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC12Q8WUD4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC12Q8WUD4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC12Q8WUD4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC12Q8WUD4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC12Q8WUD4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC12Q8WUD4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC12Q8WUD4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC12Q8WUD4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC12Q8WUD4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC12Q8WUD4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CCDC12Q8WUD4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC12Q8WUD4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC12Q8WUD4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC12Q8WUD4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC12Q8WUD4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC12Q8WUD4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC12Q8WUD4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC12Q8WUD4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC12Q8WUD4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CCDC12Q8WUD4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CCDC12Q8WUD4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC12Q8WUD4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC12Q8WUD4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CCDC12Q8WUD4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC12Q8WUD4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC12Q8WUD4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CCDC12Q8WUD4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC12Q8WUD4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC12Q8WUD4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC12Q8WUD4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC12Q8WUD4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC12Q8WUD4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC12Q8WUD4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC12Q8WUD4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC12Q8WUD4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms