Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
U2AF1L4Q8WU68 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
U2AF1L4Q8WU68 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
U2AF1L4Q8WU68 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
U2AF1L4Q8WU68 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
U2AF1L4Q8WU68 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
U2AF1L4Q8WU68 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
U2AF1L4Q8WU68 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
U2AF1L4Q8WU68 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
U2AF1L4Q8WU68 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
U2AF1L4Q8WU68 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
U2AF1L4Q8WU68 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
U2AF1L4Q8WU68 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
U2AF1L4Q8WU68 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
U2AF1L4Q8WU68 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
U2AF1L4Q8WU68 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
U2AF1L4Q8WU68 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
U2AF1L4Q8WU68 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
U2AF1L4Q8WU68 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
U2AF1L4Q8WU68 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
U2AF1L4Q8WU68 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
U2AF1L4Q8WU68 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
U2AF1L4Q8WU68 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
U2AF1L4Q8WU68 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
U2AF1L4Q8WU68 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
U2AF1L4Q8WU68 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
U2AF1L4Q8WU68 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
U2AF1L4Q8WU68 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
U2AF1L4Q8WU68 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
U2AF1L4Q8WU68 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
U2AF1L4Q8WU68 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
U2AF1L4Q8WU68 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
U2AF1L4Q8WU68 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
U2AF1L4Q8WU68 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
U2AF1L4Q8WU68 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
U2AF1L4Q8WU68 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
U2AF1L4Q8WU68 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
U2AF1L4Q8WU68 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
U2AF1L4Q8WU68 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
U2AF1L4Q8WU68 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
U2AF1L4Q8WU68 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
U2AF1L4Q8WU68 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
U2AF1L4Q8WU68 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
U2AF1L4Q8WU68 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
U2AF1L4Q8WU68 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
U2AF1L4Q8WU68 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
U2AF1L4Q8WU68 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
U2AF1L4Q8WU68 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
U2AF1L4Q8WU68 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
U2AF1L4Q8WU68 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
U2AF1L4Q8WU68 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
U2AF1L4Q8WU68 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
U2AF1L4Q8WU68 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
U2AF1L4Q8WU68 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
U2AF1L4Q8WU68 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
U2AF1L4Q8WU68 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
U2AF1L4Q8WU68 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
U2AF1L4Q8WU68 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
U2AF1L4Q8WU68 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
U2AF1L4Q8WU68 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
U2AF1L4Q8WU68 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
U2AF1L4Q8WU68 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
U2AF1L4Q8WU68 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
U2AF1L4Q8WU68 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
U2AF1L4Q8WU68 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
U2AF1L4Q8WU68 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
U2AF1L4Q8WU68 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
U2AF1L4Q8WU68 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
U2AF1L4Q8WU68 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
U2AF1L4Q8WU68 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
U2AF1L4Q8WU68 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
U2AF1L4Q8WU68 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
U2AF1L4Q8WU68 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
U2AF1L4Q8WU68 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
U2AF1L4Q8WU68 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
U2AF1L4Q8WU68 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
U2AF1L4Q8WU68 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
U2AF1L4Q8WU68 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
U2AF1L4Q8WU68 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
U2AF1L4Q8WU68 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
U2AF1L4Q8WU68 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
U2AF1L4Q8WU68 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
U2AF1L4Q8WU68 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
U2AF1L4Q8WU68 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
U2AF1L4Q8WU68 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
U2AF1L4Q8WU68 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
U2AF1L4Q8WU68 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
U2AF1L4Q8WU68 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
U2AF1L4Q8WU68 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
U2AF1L4Q8WU68 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
U2AF1L4Q8WU68 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
U2AF1L4Q8WU68 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
U2AF1L4Q8WU68 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
U2AF1L4Q8WU68 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
U2AF1L4Q8WU68 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
U2AF1L4Q8WU68 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
U2AF1L4Q8WU68 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
U2AF1L4Q8WU68 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
U2AF1L4Q8WU68 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
U2AF1L4Q8WU68 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms