Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDQ7

GNPDA2, Glucosamine-6-phosphate isomerase 2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA2Q8TDQ7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPDA2Q8TDQ7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPDA2Q8TDQ7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPDA2Q8TDQ7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPDA2Q8TDQ7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPDA2Q8TDQ7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPDA2Q8TDQ7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPDA2Q8TDQ7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPDA2Q8TDQ7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPDA2Q8TDQ7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPDA2Q8TDQ7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPDA2Q8TDQ7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPDA2Q8TDQ7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPDA2Q8TDQ7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GNPDA2Q8TDQ7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNPDA2Q8TDQ7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GNPDA2Q8TDQ7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GNPDA2Q8TDQ7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GNPDA2Q8TDQ7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GNPDA2Q8TDQ7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GNPDA2Q8TDQ7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GNPDA2Q8TDQ7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNPDA2Q8TDQ7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GNPDA2Q8TDQ7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GNPDA2Q8TDQ7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GNPDA2Q8TDQ7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GNPDA2Q8TDQ7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GNPDA2Q8TDQ7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GNPDA2Q8TDQ7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GNPDA2Q8TDQ7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GNPDA2Q8TDQ7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GNPDA2Q8TDQ7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GNPDA2Q8TDQ7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GNPDA2Q8TDQ7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GNPDA2Q8TDQ7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GNPDA2Q8TDQ7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GNPDA2Q8TDQ7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GNPDA2Q8TDQ7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GNPDA2Q8TDQ7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GNPDA2Q8TDQ7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GNPDA2Q8TDQ7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GNPDA2Q8TDQ7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GNPDA2Q8TDQ7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GNPDA2Q8TDQ7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GNPDA2Q8TDQ7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GNPDA2Q8TDQ7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GNPDA2Q8TDQ7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GNPDA2Q8TDQ7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GNPDA2Q8TDQ7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GNPDA2Q8TDQ7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GNPDA2Q8TDQ7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GNPDA2Q8TDQ7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GNPDA2Q8TDQ7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GNPDA2Q8TDQ7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GNPDA2Q8TDQ7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GNPDA2Q8TDQ7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GNPDA2Q8TDQ7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GNPDA2Q8TDQ7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GNPDA2Q8TDQ7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GNPDA2Q8TDQ7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GNPDA2Q8TDQ7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GNPDA2Q8TDQ7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNPDA2Q8TDQ7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNPDA2Q8TDQ7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNPDA2Q8TDQ7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNPDA2Q8TDQ7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GNPDA2Q8TDQ7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNPDA2Q8TDQ7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNPDA2Q8TDQ7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNPDA2Q8TDQ7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNPDA2Q8TDQ7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNPDA2Q8TDQ7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNPDA2Q8TDQ7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GNPDA2Q8TDQ7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNPDA2Q8TDQ7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GNPDA2Q8TDQ7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNPDA2Q8TDQ7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GNPDA2Q8TDQ7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GNPDA2Q8TDQ7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GNPDA2Q8TDQ7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GNPDA2Q8TDQ7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPDA2Q8TDQ7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPDA2Q8TDQ7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPDA2Q8TDQ7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GNPDA2Q8TDQ7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPDA2Q8TDQ7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPDA2Q8TDQ7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPDA2Q8TDQ7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GNPDA2Q8TDQ7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPDA2Q8TDQ7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPDA2Q8TDQ7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPDA2Q8TDQ7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPDA2Q8TDQ7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPDA2Q8TDQ7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPDA2Q8TDQ7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPDA2Q8TDQ7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPDA2Q8TDQ7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPDA2Q8TDQ7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GNPDA2Q8TDQ7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms