Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAL5

C9orf43, Uncharacterized protein C9orf43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf43Q8TAL5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf43Q8TAL5 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf43Q8TAL5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf43Q8TAL5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf43Q8TAL5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C9orf43Q8TAL5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C9orf43Q8TAL5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C9orf43Q8TAL5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C9orf43Q8TAL5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C9orf43Q8TAL5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C9orf43Q8TAL5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C9orf43Q8TAL5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C9orf43Q8TAL5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C9orf43Q8TAL5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf43Q8TAL5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf43Q8TAL5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf43Q8TAL5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf43Q8TAL5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf43Q8TAL5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf43Q8TAL5 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf43Q8TAL5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf43Q8TAL5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf43Q8TAL5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf43Q8TAL5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C9orf43Q8TAL5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C9orf43Q8TAL5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf43Q8TAL5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf43Q8TAL5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf43Q8TAL5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf43Q8TAL5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C9orf43Q8TAL5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf43Q8TAL5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf43Q8TAL5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C9orf43Q8TAL5 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C9orf43Q8TAL5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C9orf43Q8TAL5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C9orf43Q8TAL5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C9orf43Q8TAL5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C9orf43Q8TAL5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C9orf43Q8TAL5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C9orf43Q8TAL5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C9orf43Q8TAL5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C9orf43Q8TAL5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C9orf43Q8TAL5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C9orf43Q8TAL5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C9orf43Q8TAL5 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C9orf43Q8TAL5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C9orf43Q8TAL5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C9orf43Q8TAL5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C9orf43Q8TAL5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C9orf43Q8TAL5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C9orf43Q8TAL5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf43Q8TAL5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C9orf43Q8TAL5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms