Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG31

KNL1, Kinetochore scaffold 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNL1Q8NG31 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNL1Q8NG31 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNL1Q8NG31 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNL1Q8NG31 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KNL1Q8NG31 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNL1Q8NG31 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KNL1Q8NG31 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
KNL1Q8NG31 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNL1Q8NG31 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNL1Q8NG31 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNL1Q8NG31 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNL1Q8NG31 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNL1Q8NG31 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNL1Q8NG31 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNL1Q8NG31 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KNL1Q8NG31 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KNL1Q8NG31 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNL1Q8NG31 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KNL1Q8NG31 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNL1Q8NG31 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KNL1Q8NG31 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
KNL1Q8NG31 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
KNL1Q8NG31 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
KNL1Q8NG31 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KNL1Q8NG31 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KNL1Q8NG31 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KNL1Q8NG31 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KNL1Q8NG31 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KNL1Q8NG31 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KNL1Q8NG31 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNL1Q8NG31 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNL1Q8NG31 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNL1Q8NG31 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KNL1Q8NG31 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KNL1Q8NG31 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNL1Q8NG31 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNL1Q8NG31 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KNL1Q8NG31 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KNL1Q8NG31 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KNL1Q8NG31 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNL1Q8NG31 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KNL1Q8NG31 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNL1Q8NG31 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNL1Q8NG31 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNL1Q8NG31 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNL1Q8NG31 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNL1Q8NG31 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNL1Q8NG31 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KNL1Q8NG31 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNL1Q8NG31 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNL1Q8NG31 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KNL1Q8NG31 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KNL1Q8NG31 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KNL1Q8NG31 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KNL1Q8NG31 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KNL1Q8NG31 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KNL1Q8NG31 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KNL1Q8NG31 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KNL1Q8NG31 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KNL1Q8NG31 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms