Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG06

TRIM58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM58Q8NG06 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM58Q8NG06 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM58Q8NG06 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM58Q8NG06 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM58Q8NG06 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM58Q8NG06 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM58Q8NG06 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM58Q8NG06 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM58Q8NG06 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM58Q8NG06 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM58Q8NG06 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM58Q8NG06 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM58Q8NG06 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM58Q8NG06 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM58Q8NG06 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM58Q8NG06 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM58Q8NG06 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM58Q8NG06 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM58Q8NG06 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM58Q8NG06 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM58Q8NG06 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM58Q8NG06 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM58Q8NG06 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM58Q8NG06 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM58Q8NG06 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM58Q8NG06 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM58Q8NG06 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM58Q8NG06 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM58Q8NG06 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM58Q8NG06 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM58Q8NG06 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM58Q8NG06 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM58Q8NG06 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM58Q8NG06 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM58Q8NG06 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM58Q8NG06 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM58Q8NG06 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM58Q8NG06 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM58Q8NG06 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM58Q8NG06 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM58Q8NG06 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM58Q8NG06 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM58Q8NG06 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM58Q8NG06 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM58Q8NG06 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM58Q8NG06 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM58Q8NG06 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM58Q8NG06 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM58Q8NG06 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM58Q8NG06 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM58Q8NG06 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRIM58Q8NG06 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM58Q8NG06 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM58Q8NG06 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM58Q8NG06 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRIM58Q8NG06 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM58Q8NG06 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TRIM58Q8NG06 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM58Q8NG06 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM58Q8NG06 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM58Q8NG06 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRIM58Q8NG06 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRIM58Q8NG06 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM58Q8NG06 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM58Q8NG06 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM58Q8NG06 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM58Q8NG06 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRIM58Q8NG06 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM58Q8NG06 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM58Q8NG06 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM58Q8NG06 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM58Q8NG06 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM58Q8NG06 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRIM58Q8NG06 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM58Q8NG06 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM58Q8NG06 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM58Q8NG06 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM58Q8NG06 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM58Q8NG06 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRIM58Q8NG06 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM58Q8NG06 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRIM58Q8NG06 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM58Q8NG06 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM58Q8NG06 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM58Q8NG06 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM58Q8NG06 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM58Q8NG06 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM58Q8NG06 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM58Q8NG06 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM58Q8NG06 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRIM58Q8NG06 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM58Q8NG06 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM58Q8NG06 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM58Q8NG06 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM58Q8NG06 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM58Q8NG06 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRIM58Q8NG06 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM58Q8NG06 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM58Q8NG06 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRIM58Q8NG06 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms