Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFT8

DNER, Delta and Notch-like epidermal growth factor-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNERQ8NFT8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DNERQ8NFT8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
DNERQ8NFT8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
DNERQ8NFT8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DNERQ8NFT8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DNERQ8NFT8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
DNERQ8NFT8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
DNERQ8NFT8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
DNERQ8NFT8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DNERQ8NFT8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DNERQ8NFT8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DNERQ8NFT8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNERQ8NFT8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNERQ8NFT8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNERQ8NFT8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
DNERQ8NFT8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNERQ8NFT8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DNERQ8NFT8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DNERQ8NFT8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DNERQ8NFT8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
DNERQ8NFT8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DNERQ8NFT8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DNERQ8NFT8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
DNERQ8NFT8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
DNERQ8NFT8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DNERQ8NFT8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DNERQ8NFT8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DNERQ8NFT8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
DNERQ8NFT8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNERQ8NFT8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNERQ8NFT8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNERQ8NFT8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DNERQ8NFT8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DNERQ8NFT8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DNERQ8NFT8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DNERQ8NFT8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNERQ8NFT8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
DNERQ8NFT8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DNERQ8NFT8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNERQ8NFT8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNERQ8NFT8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DNERQ8NFT8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNERQ8NFT8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNERQ8NFT8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNERQ8NFT8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNERQ8NFT8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNERQ8NFT8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNERQ8NFT8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNERQ8NFT8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNERQ8NFT8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DNERQ8NFT8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DNERQ8NFT8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DNERQ8NFT8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
DNERQ8NFT8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DNERQ8NFT8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DNERQ8NFT8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNERQ8NFT8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNERQ8NFT8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNERQ8NFT8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNERQ8NFT8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DNERQ8NFT8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
DNERQ8NFT8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
DNERQ8NFT8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
DNERQ8NFT8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
DNERQ8NFT8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
DNERQ8NFT8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
DNERQ8NFT8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNERQ8NFT8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNERQ8NFT8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNERQ8NFT8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNERQ8NFT8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNERQ8NFT8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNERQ8NFT8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DNERQ8NFT8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNERQ8NFT8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNERQ8NFT8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNERQ8NFT8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNERQ8NFT8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DNERQ8NFT8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNERQ8NFT8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DNERQ8NFT8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DNERQ8NFT8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
DNERQ8NFT8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DNERQ8NFT8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
DNERQ8NFT8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DNERQ8NFT8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
DNERQ8NFT8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DNERQ8NFT8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DNERQ8NFT8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
DNERQ8NFT8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNERQ8NFT8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
DNERQ8NFT8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNERQ8NFT8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNERQ8NFT8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DNERQ8NFT8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNERQ8NFT8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNERQ8NFT8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNERQ8NFT8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNERQ8NFT8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DNERQ8NFT8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms