Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH3

NUP43, Nucleoporin Nup43, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP43Q8NFH3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP43Q8NFH3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NUP43Q8NFH3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP43Q8NFH3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP43Q8NFH3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP43Q8NFH3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NUP43Q8NFH3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP43Q8NFH3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP43Q8NFH3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NUP43Q8NFH3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP43Q8NFH3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NUP43Q8NFH3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP43Q8NFH3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NUP43Q8NFH3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP43Q8NFH3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP43Q8NFH3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP43Q8NFH3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP43Q8NFH3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP43Q8NFH3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP43Q8NFH3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP43Q8NFH3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP43Q8NFH3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP43Q8NFH3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP43Q8NFH3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP43Q8NFH3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP43Q8NFH3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP43Q8NFH3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP43Q8NFH3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP43Q8NFH3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP43Q8NFH3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP43Q8NFH3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP43Q8NFH3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP43Q8NFH3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP43Q8NFH3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP43Q8NFH3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP43Q8NFH3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP43Q8NFH3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP43Q8NFH3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP43Q8NFH3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP43Q8NFH3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP43Q8NFH3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP43Q8NFH3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP43Q8NFH3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP43Q8NFH3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP43Q8NFH3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP43Q8NFH3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP43Q8NFH3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP43Q8NFH3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP43Q8NFH3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP43Q8NFH3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP43Q8NFH3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP43Q8NFH3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP43Q8NFH3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP43Q8NFH3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP43Q8NFH3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP43Q8NFH3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP43Q8NFH3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP43Q8NFH3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP43Q8NFH3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP43Q8NFH3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP43Q8NFH3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP43Q8NFH3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP43Q8NFH3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUP43Q8NFH3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP43Q8NFH3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP43Q8NFH3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NUP43Q8NFH3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP43Q8NFH3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP43Q8NFH3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NUP43Q8NFH3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
NUP43Q8NFH3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP43Q8NFH3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP43Q8NFH3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP43Q8NFH3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP43Q8NFH3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP43Q8NFH3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP43Q8NFH3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP43Q8NFH3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NUP43Q8NFH3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP43Q8NFH3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP43Q8NFH3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP43Q8NFH3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP43Q8NFH3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP43Q8NFH3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP43Q8NFH3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP43Q8NFH3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP43Q8NFH3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP43Q8NFH3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NUP43Q8NFH3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP43Q8NFH3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP43Q8NFH3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP43Q8NFH3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP43Q8NFH3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP43Q8NFH3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NUP43Q8NFH3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP43Q8NFH3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP43Q8NFH3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP43Q8NFH3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP43Q8NFH3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NUP43Q8NFH3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms