Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEZ2

VPS37A, Vacuolar protein sorting-associated protein 37A, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37AQ8NEZ2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS37AQ8NEZ2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS37AQ8NEZ2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS37AQ8NEZ2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS37AQ8NEZ2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS37AQ8NEZ2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS37AQ8NEZ2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VPS37AQ8NEZ2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS37AQ8NEZ2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS37AQ8NEZ2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS37AQ8NEZ2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS37AQ8NEZ2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS37AQ8NEZ2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VPS37AQ8NEZ2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS37AQ8NEZ2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS37AQ8NEZ2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS37AQ8NEZ2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS37AQ8NEZ2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS37AQ8NEZ2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS37AQ8NEZ2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS37AQ8NEZ2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS37AQ8NEZ2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VPS37AQ8NEZ2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS37AQ8NEZ2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS37AQ8NEZ2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VPS37AQ8NEZ2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS37AQ8NEZ2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VPS37AQ8NEZ2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS37AQ8NEZ2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS37AQ8NEZ2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VPS37AQ8NEZ2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS37AQ8NEZ2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS37AQ8NEZ2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VPS37AQ8NEZ2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS37AQ8NEZ2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS37AQ8NEZ2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS37AQ8NEZ2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS37AQ8NEZ2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VPS37AQ8NEZ2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS37AQ8NEZ2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS37AQ8NEZ2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VPS37AQ8NEZ2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS37AQ8NEZ2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS37AQ8NEZ2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS37AQ8NEZ2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
VPS37AQ8NEZ2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS37AQ8NEZ2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS37AQ8NEZ2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS37AQ8NEZ2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS37AQ8NEZ2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VPS37AQ8NEZ2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS37AQ8NEZ2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS37AQ8NEZ2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS37AQ8NEZ2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
VPS37AQ8NEZ2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS37AQ8NEZ2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS37AQ8NEZ2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS37AQ8NEZ2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VPS37AQ8NEZ2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37AQ8NEZ2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37AQ8NEZ2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
VPS37AQ8NEZ2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37AQ8NEZ2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37AQ8NEZ2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37AQ8NEZ2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
VPS37AQ8NEZ2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37AQ8NEZ2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37AQ8NEZ2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37AQ8NEZ2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37AQ8NEZ2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37AQ8NEZ2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
VPS37AQ8NEZ2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VPS37AQ8NEZ2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
VPS37AQ8NEZ2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37AQ8NEZ2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37AQ8NEZ2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VPS37AQ8NEZ2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37AQ8NEZ2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37AQ8NEZ2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37AQ8NEZ2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37AQ8NEZ2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VPS37AQ8NEZ2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37AQ8NEZ2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37AQ8NEZ2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37AQ8NEZ2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37AQ8NEZ2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37AQ8NEZ2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VPS37AQ8NEZ2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37AQ8NEZ2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37AQ8NEZ2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37AQ8NEZ2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VPS37AQ8NEZ2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37AQ8NEZ2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37AQ8NEZ2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37AQ8NEZ2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VPS37AQ8NEZ2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37AQ8NEZ2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37AQ8NEZ2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VPS37AQ8NEZ2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
VPS37AQ8NEZ2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms