Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM46DQ8NEK8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM46DQ8NEK8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM46DQ8NEK8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM46DQ8NEK8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM46DQ8NEK8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM46DQ8NEK8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM46DQ8NEK8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM46DQ8NEK8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM46DQ8NEK8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM46DQ8NEK8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM46DQ8NEK8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM46DQ8NEK8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM46DQ8NEK8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM46DQ8NEK8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM46DQ8NEK8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM46DQ8NEK8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM46DQ8NEK8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM46DQ8NEK8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM46DQ8NEK8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM46DQ8NEK8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM46DQ8NEK8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM46DQ8NEK8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM46DQ8NEK8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM46DQ8NEK8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM46DQ8NEK8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM46DQ8NEK8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM46DQ8NEK8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM46DQ8NEK8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM46DQ8NEK8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM46DQ8NEK8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM46DQ8NEK8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM46DQ8NEK8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM46DQ8NEK8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM46DQ8NEK8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM46DQ8NEK8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM46DQ8NEK8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM46DQ8NEK8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM46DQ8NEK8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM46DQ8NEK8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM46DQ8NEK8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM46DQ8NEK8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM46DQ8NEK8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM46DQ8NEK8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM46DQ8NEK8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM46DQ8NEK8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM46DQ8NEK8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM46DQ8NEK8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM46DQ8NEK8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM46DQ8NEK8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM46DQ8NEK8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM46DQ8NEK8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM46DQ8NEK8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FAM46DQ8NEK8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM46DQ8NEK8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM46DQ8NEK8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM46DQ8NEK8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM46DQ8NEK8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM46DQ8NEK8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM46DQ8NEK8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM46DQ8NEK8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms