Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN5

PDPR, Pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPRQ8NCN5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDPRQ8NCN5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDPRQ8NCN5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDPRQ8NCN5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDPRQ8NCN5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDPRQ8NCN5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDPRQ8NCN5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDPRQ8NCN5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDPRQ8NCN5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDPRQ8NCN5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDPRQ8NCN5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDPRQ8NCN5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDPRQ8NCN5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDPRQ8NCN5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDPRQ8NCN5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDPRQ8NCN5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDPRQ8NCN5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDPRQ8NCN5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDPRQ8NCN5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDPRQ8NCN5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDPRQ8NCN5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PDPRQ8NCN5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDPRQ8NCN5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDPRQ8NCN5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDPRQ8NCN5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDPRQ8NCN5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDPRQ8NCN5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDPRQ8NCN5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PDPRQ8NCN5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDPRQ8NCN5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDPRQ8NCN5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDPRQ8NCN5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDPRQ8NCN5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDPRQ8NCN5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDPRQ8NCN5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDPRQ8NCN5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PDPRQ8NCN5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDPRQ8NCN5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDPRQ8NCN5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDPRQ8NCN5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDPRQ8NCN5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDPRQ8NCN5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDPRQ8NCN5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDPRQ8NCN5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDPRQ8NCN5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDPRQ8NCN5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDPRQ8NCN5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDPRQ8NCN5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDPRQ8NCN5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDPRQ8NCN5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDPRQ8NCN5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDPRQ8NCN5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDPRQ8NCN5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDPRQ8NCN5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PDPRQ8NCN5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDPRQ8NCN5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDPRQ8NCN5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDPRQ8NCN5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDPRQ8NCN5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDPRQ8NCN5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDPRQ8NCN5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDPRQ8NCN5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDPRQ8NCN5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDPRQ8NCN5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDPRQ8NCN5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDPRQ8NCN5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDPRQ8NCN5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDPRQ8NCN5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PDPRQ8NCN5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDPRQ8NCN5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDPRQ8NCN5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDPRQ8NCN5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDPRQ8NCN5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDPRQ8NCN5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDPRQ8NCN5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDPRQ8NCN5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDPRQ8NCN5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDPRQ8NCN5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDPRQ8NCN5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDPRQ8NCN5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDPRQ8NCN5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDPRQ8NCN5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDPRQ8NCN5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDPRQ8NCN5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDPRQ8NCN5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms