Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5J2

MINDY1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY1Q8N5J2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MINDY1Q8N5J2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MINDY1Q8N5J2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MINDY1Q8N5J2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MINDY1Q8N5J2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MINDY1Q8N5J2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MINDY1Q8N5J2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MINDY1Q8N5J2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MINDY1Q8N5J2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MINDY1Q8N5J2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MINDY1Q8N5J2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MINDY1Q8N5J2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MINDY1Q8N5J2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MINDY1Q8N5J2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MINDY1Q8N5J2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MINDY1Q8N5J2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MINDY1Q8N5J2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MINDY1Q8N5J2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MINDY1Q8N5J2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MINDY1Q8N5J2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MINDY1Q8N5J2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MINDY1Q8N5J2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MINDY1Q8N5J2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MINDY1Q8N5J2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MINDY1Q8N5J2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MINDY1Q8N5J2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MINDY1Q8N5J2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MINDY1Q8N5J2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MINDY1Q8N5J2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MINDY1Q8N5J2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MINDY1Q8N5J2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MINDY1Q8N5J2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MINDY1Q8N5J2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MINDY1Q8N5J2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MINDY1Q8N5J2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MINDY1Q8N5J2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MINDY1Q8N5J2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MINDY1Q8N5J2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MINDY1Q8N5J2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MINDY1Q8N5J2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MINDY1Q8N5J2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MINDY1Q8N5J2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MINDY1Q8N5J2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MINDY1Q8N5J2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MINDY1Q8N5J2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MINDY1Q8N5J2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MINDY1Q8N5J2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MINDY1Q8N5J2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MINDY1Q8N5J2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MINDY1Q8N5J2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MINDY1Q8N5J2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MINDY1Q8N5J2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MINDY1Q8N5J2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MINDY1Q8N5J2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MINDY1Q8N5J2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MINDY1Q8N5J2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MINDY1Q8N5J2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MINDY1Q8N5J2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MINDY1Q8N5J2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MINDY1Q8N5J2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MINDY1Q8N5J2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MINDY1Q8N5J2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
MINDY1Q8N5J2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MINDY1Q8N5J2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MINDY1Q8N5J2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MINDY1Q8N5J2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MINDY1Q8N5J2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MINDY1Q8N5J2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MINDY1Q8N5J2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MINDY1Q8N5J2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MINDY1Q8N5J2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MINDY1Q8N5J2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MINDY1Q8N5J2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MINDY1Q8N5J2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MINDY1Q8N5J2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MINDY1Q8N5J2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MINDY1Q8N5J2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MINDY1Q8N5J2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MINDY1Q8N5J2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MINDY1Q8N5J2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MINDY1Q8N5J2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MINDY1Q8N5J2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MINDY1Q8N5J2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MINDY1Q8N5J2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MINDY1Q8N5J2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MINDY1Q8N5J2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MINDY1Q8N5J2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MINDY1Q8N5J2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MINDY1Q8N5J2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MINDY1Q8N5J2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MINDY1Q8N5J2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MINDY1Q8N5J2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MINDY1Q8N5J2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MINDY1Q8N5J2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MINDY1Q8N5J2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MINDY1Q8N5J2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MINDY1Q8N5J2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MINDY1Q8N5J2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MINDY1Q8N5J2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MINDY1Q8N5J2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms