Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Z3

SPICE1, Spindle and centriole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPICE1Q8N0Z3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SPICE1Q8N0Z3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPICE1Q8N0Z3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SPICE1Q8N0Z3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SPICE1Q8N0Z3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SPICE1Q8N0Z3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SPICE1Q8N0Z3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SPICE1Q8N0Z3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SPICE1Q8N0Z3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPICE1Q8N0Z3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SPICE1Q8N0Z3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SPICE1Q8N0Z3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SPICE1Q8N0Z3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SPICE1Q8N0Z3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SPICE1Q8N0Z3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SPICE1Q8N0Z3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SPICE1Q8N0Z3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SPICE1Q8N0Z3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SPICE1Q8N0Z3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SPICE1Q8N0Z3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SPICE1Q8N0Z3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SPICE1Q8N0Z3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SPICE1Q8N0Z3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SPICE1Q8N0Z3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPICE1Q8N0Z3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPICE1Q8N0Z3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPICE1Q8N0Z3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPICE1Q8N0Z3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SPICE1Q8N0Z3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SPICE1Q8N0Z3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SPICE1Q8N0Z3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SPICE1Q8N0Z3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPICE1Q8N0Z3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPICE1Q8N0Z3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPICE1Q8N0Z3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPICE1Q8N0Z3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SPICE1Q8N0Z3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPICE1Q8N0Z3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SPICE1Q8N0Z3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPICE1Q8N0Z3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPICE1Q8N0Z3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPICE1Q8N0Z3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SPICE1Q8N0Z3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPICE1Q8N0Z3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SPICE1Q8N0Z3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPICE1Q8N0Z3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SPICE1Q8N0Z3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPICE1Q8N0Z3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPICE1Q8N0Z3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPICE1Q8N0Z3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPICE1Q8N0Z3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPICE1Q8N0Z3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SPICE1Q8N0Z3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPICE1Q8N0Z3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPICE1Q8N0Z3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPICE1Q8N0Z3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPICE1Q8N0Z3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPICE1Q8N0Z3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPICE1Q8N0Z3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPICE1Q8N0Z3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPICE1Q8N0Z3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SPICE1Q8N0Z3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPICE1Q8N0Z3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPICE1Q8N0Z3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SPICE1Q8N0Z3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SPICE1Q8N0Z3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPICE1Q8N0Z3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPICE1Q8N0Z3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPICE1Q8N0Z3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SPICE1Q8N0Z3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPICE1Q8N0Z3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPICE1Q8N0Z3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPICE1Q8N0Z3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPICE1Q8N0Z3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SPICE1Q8N0Z3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPICE1Q8N0Z3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPICE1Q8N0Z3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPICE1Q8N0Z3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPICE1Q8N0Z3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPICE1Q8N0Z3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPICE1Q8N0Z3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPICE1Q8N0Z3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPICE1Q8N0Z3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SPICE1Q8N0Z3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPICE1Q8N0Z3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPICE1Q8N0Z3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPICE1Q8N0Z3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPICE1Q8N0Z3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPICE1Q8N0Z3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPICE1Q8N0Z3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPICE1Q8N0Z3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SPICE1Q8N0Z3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SPICE1Q8N0Z3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
SPICE1Q8N0Z3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SPICE1Q8N0Z3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPICE1Q8N0Z3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPICE1Q8N0Z3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPICE1Q8N0Z3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPICE1Q8N0Z3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPICE1Q8N0Z3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms