Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU9

KIRREL3, Kin of IRRE-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIRREL3Q8IZU9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIRREL3Q8IZU9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KIRREL3Q8IZU9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KIRREL3Q8IZU9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
KIRREL3Q8IZU9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIRREL3Q8IZU9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIRREL3Q8IZU9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIRREL3Q8IZU9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIRREL3Q8IZU9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIRREL3Q8IZU9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KIRREL3Q8IZU9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIRREL3Q8IZU9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIRREL3Q8IZU9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIRREL3Q8IZU9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIRREL3Q8IZU9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIRREL3Q8IZU9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIRREL3Q8IZU9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIRREL3Q8IZU9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIRREL3Q8IZU9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KIRREL3Q8IZU9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIRREL3Q8IZU9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KIRREL3Q8IZU9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIRREL3Q8IZU9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIRREL3Q8IZU9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIRREL3Q8IZU9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KIRREL3Q8IZU9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIRREL3Q8IZU9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIRREL3Q8IZU9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIRREL3Q8IZU9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIRREL3Q8IZU9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
KIRREL3Q8IZU9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KIRREL3Q8IZU9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIRREL3Q8IZU9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIRREL3Q8IZU9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIRREL3Q8IZU9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIRREL3Q8IZU9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIRREL3Q8IZU9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIRREL3Q8IZU9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIRREL3Q8IZU9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIRREL3Q8IZU9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIRREL3Q8IZU9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIRREL3Q8IZU9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIRREL3Q8IZU9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KIRREL3Q8IZU9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIRREL3Q8IZU9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIRREL3Q8IZU9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KIRREL3Q8IZU9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIRREL3Q8IZU9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIRREL3Q8IZU9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIRREL3Q8IZU9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIRREL3Q8IZU9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIRREL3Q8IZU9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIRREL3Q8IZU9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIRREL3Q8IZU9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIRREL3Q8IZU9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIRREL3Q8IZU9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIRREL3Q8IZU9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIRREL3Q8IZU9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIRREL3Q8IZU9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIRREL3Q8IZU9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIRREL3Q8IZU9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIRREL3Q8IZU9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIRREL3Q8IZU9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KIRREL3Q8IZU9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms