Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVT2

MISP, Mitotic interactor and substrate of PLK1, humanhuman

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MISPQ8IVT2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MISPQ8IVT2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MISPQ8IVT2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MISPQ8IVT2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MISPQ8IVT2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MISPQ8IVT2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MISPQ8IVT2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MISPQ8IVT2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MISPQ8IVT2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MISPQ8IVT2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MISPQ8IVT2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MISPQ8IVT2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MISPQ8IVT2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MISPQ8IVT2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MISPQ8IVT2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MISPQ8IVT2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MISPQ8IVT2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MISPQ8IVT2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MISPQ8IVT2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MISPQ8IVT2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MISPQ8IVT2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MISPQ8IVT2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MISPQ8IVT2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MISPQ8IVT2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MISPQ8IVT2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MISPQ8IVT2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MISPQ8IVT2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MISPQ8IVT2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MISPQ8IVT2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MISPQ8IVT2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MISPQ8IVT2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MISPQ8IVT2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
MISPQ8IVT2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MISPQ8IVT2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MISPQ8IVT2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MISPQ8IVT2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MISPQ8IVT2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MISPQ8IVT2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MISPQ8IVT2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MISPQ8IVT2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MISPQ8IVT2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MISPQ8IVT2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MISPQ8IVT2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MISPQ8IVT2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MISPQ8IVT2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MISPQ8IVT2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MISPQ8IVT2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MISPQ8IVT2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MISPQ8IVT2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MISPQ8IVT2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MISPQ8IVT2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MISPQ8IVT2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MISPQ8IVT2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MISPQ8IVT2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MISPQ8IVT2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MISPQ8IVT2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MISPQ8IVT2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
MISPQ8IVT2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MISPQ8IVT2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MISPQ8IVT2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MISPQ8IVT2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MISPQ8IVT2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MISPQ8IVT2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms