Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC84Q86UT8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC84Q86UT8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC84Q86UT8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC84Q86UT8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC84Q86UT8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC84Q86UT8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC84Q86UT8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC84Q86UT8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC84Q86UT8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC84Q86UT8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC84Q86UT8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC84Q86UT8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC84Q86UT8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC84Q86UT8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC84Q86UT8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC84Q86UT8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC84Q86UT8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC84Q86UT8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC84Q86UT8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC84Q86UT8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC84Q86UT8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC84Q86UT8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC84Q86UT8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC84Q86UT8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC84Q86UT8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC84Q86UT8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC84Q86UT8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC84Q86UT8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC84Q86UT8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC84Q86UT8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC84Q86UT8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC84Q86UT8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC84Q86UT8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC84Q86UT8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC84Q86UT8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC84Q86UT8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC84Q86UT8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC84Q86UT8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC84Q86UT8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC84Q86UT8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC84Q86UT8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC84Q86UT8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC84Q86UT8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC84Q86UT8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC84Q86UT8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC84Q86UT8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC84Q86UT8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC84Q86UT8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC84Q86UT8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC84Q86UT8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC84Q86UT8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC84Q86UT8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC84Q86UT8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC84Q86UT8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC84Q86UT8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC84Q86UT8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC84Q86UT8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC84Q86UT8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC84Q86UT8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC84Q86UT8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC84Q86UT8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC84Q86UT8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC84Q86UT8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC84Q86UT8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC84Q86UT8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC84Q86UT8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC84Q86UT8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC84Q86UT8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC84Q86UT8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC84Q86UT8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC84Q86UT8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC84Q86UT8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC84Q86UT8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC84Q86UT8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC84Q86UT8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC84Q86UT8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC84Q86UT8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC84Q86UT8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC84Q86UT8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC84Q86UT8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC84Q86UT8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC84Q86UT8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC84Q86UT8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC84Q86UT8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC84Q86UT8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC84Q86UT8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC84Q86UT8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CCDC84Q86UT8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC84Q86UT8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC84Q86UT8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC84Q86UT8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC84Q86UT8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CCDC84Q86UT8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC84Q86UT8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC84Q86UT8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC84Q86UT8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC84Q86UT8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC84Q86UT8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC84Q86UT8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.2 ms