Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRX1Q86UT6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NLRX1Q86UT6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NLRX1Q86UT6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRX1Q86UT6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRX1Q86UT6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NLRX1Q86UT6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRX1Q86UT6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRX1Q86UT6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NLRX1Q86UT6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NLRX1Q86UT6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NLRX1Q86UT6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NLRX1Q86UT6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NLRX1Q86UT6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NLRX1Q86UT6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NLRX1Q86UT6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRX1Q86UT6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRX1Q86UT6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRX1Q86UT6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRX1Q86UT6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NLRX1Q86UT6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRX1Q86UT6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRX1Q86UT6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NLRX1Q86UT6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRX1Q86UT6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRX1Q86UT6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRX1Q86UT6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NLRX1Q86UT6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRX1Q86UT6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRX1Q86UT6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRX1Q86UT6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRX1Q86UT6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NLRX1Q86UT6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRX1Q86UT6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NLRX1Q86UT6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRX1Q86UT6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NLRX1Q86UT6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NLRX1Q86UT6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NLRX1Q86UT6 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRX1Q86UT6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRX1Q86UT6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRX1Q86UT6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRX1Q86UT6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NLRX1Q86UT6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRX1Q86UT6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRX1Q86UT6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRX1Q86UT6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRX1Q86UT6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRX1Q86UT6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRX1Q86UT6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRX1Q86UT6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRX1Q86UT6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NLRX1Q86UT6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NLRX1Q86UT6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRX1Q86UT6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NLRX1Q86UT6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRX1Q86UT6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRX1Q86UT6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NLRX1Q86UT6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NLRX1Q86UT6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NLRX1Q86UT6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NLRX1Q86UT6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NLRX1Q86UT6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NLRX1Q86UT6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
NLRX1Q86UT6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NLRX1Q86UT6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRX1Q86UT6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRX1Q86UT6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRX1Q86UT6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRX1Q86UT6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NLRX1Q86UT6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRX1Q86UT6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRX1Q86UT6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRX1Q86UT6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRX1Q86UT6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NLRX1Q86UT6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRX1Q86UT6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRX1Q86UT6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NLRX1Q86UT6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRX1Q86UT6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRX1Q86UT6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRX1Q86UT6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NLRX1Q86UT6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRX1Q86UT6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRX1Q86UT6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRX1Q86UT6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRX1Q86UT6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRX1Q86UT6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRX1Q86UT6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NLRX1Q86UT6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRX1Q86UT6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRX1Q86UT6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRX1Q86UT6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRX1Q86UT6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NLRX1Q86UT6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRX1Q86UT6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRX1Q86UT6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRX1Q86UT6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NLRX1Q86UT6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NLRX1Q86UT6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms