Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG4DQ86TL0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATG4DQ86TL0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG4DQ86TL0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG4DQ86TL0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG4DQ86TL0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ATG4DQ86TL0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG4DQ86TL0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG4DQ86TL0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG4DQ86TL0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG4DQ86TL0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG4DQ86TL0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG4DQ86TL0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATG4DQ86TL0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG4DQ86TL0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG4DQ86TL0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG4DQ86TL0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG4DQ86TL0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG4DQ86TL0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG4DQ86TL0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATG4DQ86TL0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG4DQ86TL0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG4DQ86TL0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATG4DQ86TL0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4DQ86TL0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4DQ86TL0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4DQ86TL0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4DQ86TL0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4DQ86TL0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATG4DQ86TL0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATG4DQ86TL0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG4DQ86TL0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG4DQ86TL0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG4DQ86TL0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG4DQ86TL0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG4DQ86TL0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG4DQ86TL0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATG4DQ86TL0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4DQ86TL0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4DQ86TL0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4DQ86TL0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4DQ86TL0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATG4DQ86TL0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4DQ86TL0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4DQ86TL0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4DQ86TL0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4DQ86TL0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4DQ86TL0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATG4DQ86TL0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG4DQ86TL0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG4DQ86TL0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG4DQ86TL0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATG4DQ86TL0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG4DQ86TL0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG4DQ86TL0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG4DQ86TL0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG4DQ86TL0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATG4DQ86TL0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG4DQ86TL0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATG4DQ86TL0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATG4DQ86TL0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATG4DQ86TL0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms