Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYT9Q86SS6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT9Q86SS6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT9Q86SS6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT9Q86SS6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT9Q86SS6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT9Q86SS6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYT9Q86SS6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT9Q86SS6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT9Q86SS6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT9Q86SS6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT9Q86SS6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYT9Q86SS6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT9Q86SS6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT9Q86SS6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT9Q86SS6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT9Q86SS6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYT9Q86SS6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT9Q86SS6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYT9Q86SS6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT9Q86SS6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT9Q86SS6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT9Q86SS6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT9Q86SS6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT9Q86SS6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT9Q86SS6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT9Q86SS6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT9Q86SS6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT9Q86SS6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYT9Q86SS6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT9Q86SS6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYT9Q86SS6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT9Q86SS6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT9Q86SS6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT9Q86SS6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SYT9Q86SS6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYT9Q86SS6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SYT9Q86SS6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYT9Q86SS6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYT9Q86SS6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYT9Q86SS6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT9Q86SS6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT9Q86SS6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYT9Q86SS6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT9Q86SS6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT9Q86SS6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT9Q86SS6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT9Q86SS6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT9Q86SS6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT9Q86SS6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT9Q86SS6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT9Q86SS6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT9Q86SS6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT9Q86SS6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT9Q86SS6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT9Q86SS6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT9Q86SS6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT9Q86SS6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT9Q86SS6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms