Protein–RNA interactions for Protein: Q71RG4

TMUB2, Transmembrane and ubiquitin-like domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMUB2Q71RG4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMUB2Q71RG4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMUB2Q71RG4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMUB2Q71RG4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMUB2Q71RG4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMUB2Q71RG4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMUB2Q71RG4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMUB2Q71RG4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMUB2Q71RG4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMUB2Q71RG4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMUB2Q71RG4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMUB2Q71RG4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMUB2Q71RG4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TMUB2Q71RG4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMUB2Q71RG4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMUB2Q71RG4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMUB2Q71RG4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMUB2Q71RG4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMUB2Q71RG4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMUB2Q71RG4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMUB2Q71RG4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMUB2Q71RG4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMUB2Q71RG4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMUB2Q71RG4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMUB2Q71RG4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMUB2Q71RG4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMUB2Q71RG4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMUB2Q71RG4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMUB2Q71RG4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMUB2Q71RG4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMUB2Q71RG4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMUB2Q71RG4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMUB2Q71RG4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMUB2Q71RG4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMUB2Q71RG4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMUB2Q71RG4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMUB2Q71RG4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMUB2Q71RG4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMUB2Q71RG4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMUB2Q71RG4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMUB2Q71RG4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMUB2Q71RG4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMUB2Q71RG4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMUB2Q71RG4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMUB2Q71RG4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMUB2Q71RG4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMUB2Q71RG4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMUB2Q71RG4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TMUB2Q71RG4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMUB2Q71RG4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMUB2Q71RG4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMUB2Q71RG4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMUB2Q71RG4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMUB2Q71RG4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMUB2Q71RG4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMUB2Q71RG4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMUB2Q71RG4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMUB2Q71RG4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMUB2Q71RG4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMUB2Q71RG4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMUB2Q71RG4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMUB2Q71RG4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMUB2Q71RG4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMUB2Q71RG4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMUB2Q71RG4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMUB2Q71RG4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMUB2Q71RG4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMUB2Q71RG4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMUB2Q71RG4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMUB2Q71RG4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMUB2Q71RG4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMUB2Q71RG4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMUB2Q71RG4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMUB2Q71RG4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMUB2Q71RG4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMUB2Q71RG4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMUB2Q71RG4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMUB2Q71RG4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMUB2Q71RG4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMUB2Q71RG4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TMUB2Q71RG4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMUB2Q71RG4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMUB2Q71RG4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TMUB2Q71RG4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMUB2Q71RG4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMUB2Q71RG4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMUB2Q71RG4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMUB2Q71RG4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TMUB2Q71RG4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMUB2Q71RG4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMUB2Q71RG4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMUB2Q71RG4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMUB2Q71RG4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMUB2Q71RG4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMUB2Q71RG4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMUB2Q71RG4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TMUB2Q71RG4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TMUB2Q71RG4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMUB2Q71RG4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMUB2Q71RG4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms