Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR62

RTL4, Retrotransposon Gag-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL4Q6ZR62 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTL4Q6ZR62 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTL4Q6ZR62 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTL4Q6ZR62 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTL4Q6ZR62 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTL4Q6ZR62 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTL4Q6ZR62 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RTL4Q6ZR62 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTL4Q6ZR62 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTL4Q6ZR62 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTL4Q6ZR62 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RTL4Q6ZR62 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RTL4Q6ZR62 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTL4Q6ZR62 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTL4Q6ZR62 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTL4Q6ZR62 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RTL4Q6ZR62 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTL4Q6ZR62 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTL4Q6ZR62 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTL4Q6ZR62 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTL4Q6ZR62 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RTL4Q6ZR62 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTL4Q6ZR62 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTL4Q6ZR62 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTL4Q6ZR62 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTL4Q6ZR62 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTL4Q6ZR62 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RTL4Q6ZR62 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTL4Q6ZR62 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTL4Q6ZR62 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RTL4Q6ZR62 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTL4Q6ZR62 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RTL4Q6ZR62 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTL4Q6ZR62 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTL4Q6ZR62 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTL4Q6ZR62 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RTL4Q6ZR62 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTL4Q6ZR62 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTL4Q6ZR62 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RTL4Q6ZR62 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTL4Q6ZR62 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTL4Q6ZR62 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTL4Q6ZR62 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RTL4Q6ZR62 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTL4Q6ZR62 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RTL4Q6ZR62 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTL4Q6ZR62 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTL4Q6ZR62 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTL4Q6ZR62 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RTL4Q6ZR62 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RTL4Q6ZR62 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RTL4Q6ZR62 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RTL4Q6ZR62 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RTL4Q6ZR62 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RTL4Q6ZR62 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RTL4Q6ZR62 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTL4Q6ZR62 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RTL4Q6ZR62 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.7 ms