Protein–RNA interactions for Protein: Q6XLA1

CASC2, Protein CASC2, isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC2Q6XLA1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CASC2Q6XLA1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CASC2Q6XLA1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
CASC2Q6XLA1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms