Protein–RNA interactions for Protein: Q6UY09

CEACAM20, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 20, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM20Q6UY09 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CEACAM20Q6UY09 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEACAM20Q6UY09 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEACAM20Q6UY09 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CEACAM20Q6UY09 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEACAM20Q6UY09 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CEACAM20Q6UY09 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEACAM20Q6UY09 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEACAM20Q6UY09 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEACAM20Q6UY09 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEACAM20Q6UY09 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEACAM20Q6UY09 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEACAM20Q6UY09 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEACAM20Q6UY09 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CEACAM20Q6UY09 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CEACAM20Q6UY09 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CEACAM20Q6UY09 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEACAM20Q6UY09 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEACAM20Q6UY09 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CEACAM20Q6UY09 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEACAM20Q6UY09 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEACAM20Q6UY09 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEACAM20Q6UY09 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEACAM20Q6UY09 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEACAM20Q6UY09 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEACAM20Q6UY09 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEACAM20Q6UY09 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEACAM20Q6UY09 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CEACAM20Q6UY09 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEACAM20Q6UY09 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEACAM20Q6UY09 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEACAM20Q6UY09 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEACAM20Q6UY09 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CEACAM20Q6UY09 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEACAM20Q6UY09 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEACAM20Q6UY09 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEACAM20Q6UY09 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEACAM20Q6UY09 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEACAM20Q6UY09 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEACAM20Q6UY09 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEACAM20Q6UY09 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEACAM20Q6UY09 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEACAM20Q6UY09 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEACAM20Q6UY09 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEACAM20Q6UY09 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEACAM20Q6UY09 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEACAM20Q6UY09 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEACAM20Q6UY09 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEACAM20Q6UY09 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEACAM20Q6UY09 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CEACAM20Q6UY09 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEACAM20Q6UY09 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEACAM20Q6UY09 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEACAM20Q6UY09 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEACAM20Q6UY09 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEACAM20Q6UY09 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEACAM20Q6UY09 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEACAM20Q6UY09 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEACAM20Q6UY09 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEACAM20Q6UY09 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEACAM20Q6UY09 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEACAM20Q6UY09 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEACAM20Q6UY09 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEACAM20Q6UY09 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEACAM20Q6UY09 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEACAM20Q6UY09 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEACAM20Q6UY09 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEACAM20Q6UY09 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CEACAM20Q6UY09 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEACAM20Q6UY09 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEACAM20Q6UY09 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEACAM20Q6UY09 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEACAM20Q6UY09 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEACAM20Q6UY09 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEACAM20Q6UY09 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEACAM20Q6UY09 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEACAM20Q6UY09 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEACAM20Q6UY09 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEACAM20Q6UY09 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEACAM20Q6UY09 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CEACAM20Q6UY09 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEACAM20Q6UY09 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CEACAM20Q6UY09 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEACAM20Q6UY09 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEACAM20Q6UY09 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEACAM20Q6UY09 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEACAM20Q6UY09 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEACAM20Q6UY09 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEACAM20Q6UY09 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEACAM20Q6UY09 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEACAM20Q6UY09 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEACAM20Q6UY09 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEACAM20Q6UY09 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEACAM20Q6UY09 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEACAM20Q6UY09 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEACAM20Q6UY09 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEACAM20Q6UY09 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEACAM20Q6UY09 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEACAM20Q6UY09 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CEACAM20Q6UY09 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms