Protein–RNA interactions for Protein: Q6UN15

FIP1L1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FIP1L1Q6UN15 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FIP1L1Q6UN15 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FIP1L1Q6UN15 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FIP1L1Q6UN15 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FIP1L1Q6UN15 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FIP1L1Q6UN15 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FIP1L1Q6UN15 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FIP1L1Q6UN15 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FIP1L1Q6UN15 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FIP1L1Q6UN15 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FIP1L1Q6UN15 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FIP1L1Q6UN15 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
FIP1L1Q6UN15 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FIP1L1Q6UN15 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FIP1L1Q6UN15 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FIP1L1Q6UN15 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FIP1L1Q6UN15 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
FIP1L1Q6UN15 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms