Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKC3

TXNDC11, Thioredoxin domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC11Q6PKC3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TXNDC11Q6PKC3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TXNDC11Q6PKC3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TXNDC11Q6PKC3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TXNDC11Q6PKC3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TXNDC11Q6PKC3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TXNDC11Q6PKC3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TXNDC11Q6PKC3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TXNDC11Q6PKC3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TXNDC11Q6PKC3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TXNDC11Q6PKC3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TXNDC11Q6PKC3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TXNDC11Q6PKC3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TXNDC11Q6PKC3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TXNDC11Q6PKC3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TXNDC11Q6PKC3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TXNDC11Q6PKC3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TXNDC11Q6PKC3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TXNDC11Q6PKC3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TXNDC11Q6PKC3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TXNDC11Q6PKC3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TXNDC11Q6PKC3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TXNDC11Q6PKC3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TXNDC11Q6PKC3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TXNDC11Q6PKC3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TXNDC11Q6PKC3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TXNDC11Q6PKC3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TXNDC11Q6PKC3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TXNDC11Q6PKC3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TXNDC11Q6PKC3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TXNDC11Q6PKC3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TXNDC11Q6PKC3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TXNDC11Q6PKC3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TXNDC11Q6PKC3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TXNDC11Q6PKC3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TXNDC11Q6PKC3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TXNDC11Q6PKC3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TXNDC11Q6PKC3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TXNDC11Q6PKC3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TXNDC11Q6PKC3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TXNDC11Q6PKC3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TXNDC11Q6PKC3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TXNDC11Q6PKC3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TXNDC11Q6PKC3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TXNDC11Q6PKC3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TXNDC11Q6PKC3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TXNDC11Q6PKC3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TXNDC11Q6PKC3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TXNDC11Q6PKC3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TXNDC11Q6PKC3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TXNDC11Q6PKC3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TXNDC11Q6PKC3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TXNDC11Q6PKC3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TXNDC11Q6PKC3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TXNDC11Q6PKC3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TXNDC11Q6PKC3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TXNDC11Q6PKC3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TXNDC11Q6PKC3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TXNDC11Q6PKC3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TXNDC11Q6PKC3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TXNDC11Q6PKC3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TXNDC11Q6PKC3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TXNDC11Q6PKC3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TXNDC11Q6PKC3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TXNDC11Q6PKC3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TXNDC11Q6PKC3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TXNDC11Q6PKC3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TXNDC11Q6PKC3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TXNDC11Q6PKC3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TXNDC11Q6PKC3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TXNDC11Q6PKC3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TXNDC11Q6PKC3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TXNDC11Q6PKC3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TXNDC11Q6PKC3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TXNDC11Q6PKC3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
TXNDC11Q6PKC3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TXNDC11Q6PKC3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TXNDC11Q6PKC3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TXNDC11Q6PKC3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TXNDC11Q6PKC3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TXNDC11Q6PKC3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TXNDC11Q6PKC3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TXNDC11Q6PKC3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TXNDC11Q6PKC3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TXNDC11Q6PKC3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TXNDC11Q6PKC3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TXNDC11Q6PKC3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TXNDC11Q6PKC3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TXNDC11Q6PKC3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TXNDC11Q6PKC3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TXNDC11Q6PKC3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TXNDC11Q6PKC3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TXNDC11Q6PKC3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TXNDC11Q6PKC3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TXNDC11Q6PKC3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TXNDC11Q6PKC3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TXNDC11Q6PKC3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TXNDC11Q6PKC3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TXNDC11Q6PKC3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TXNDC11Q6PKC3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms