Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBA3EQ6PEY2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBA3EQ6PEY2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBA3EQ6PEY2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBA3EQ6PEY2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TUBA3EQ6PEY2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA3EQ6PEY2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA3EQ6PEY2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA3EQ6PEY2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA3EQ6PEY2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA3EQ6PEY2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA3EQ6PEY2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA3EQ6PEY2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TUBA3EQ6PEY2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBA3EQ6PEY2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBA3EQ6PEY2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBA3EQ6PEY2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBA3EQ6PEY2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBA3EQ6PEY2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBA3EQ6PEY2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBA3EQ6PEY2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBA3EQ6PEY2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBA3EQ6PEY2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBA3EQ6PEY2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBA3EQ6PEY2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBA3EQ6PEY2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBA3EQ6PEY2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBA3EQ6PEY2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBA3EQ6PEY2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBA3EQ6PEY2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBA3EQ6PEY2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBA3EQ6PEY2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBA3EQ6PEY2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBA3EQ6PEY2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBA3EQ6PEY2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBA3EQ6PEY2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBA3EQ6PEY2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBA3EQ6PEY2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBA3EQ6PEY2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBA3EQ6PEY2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBA3EQ6PEY2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBA3EQ6PEY2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBA3EQ6PEY2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA3EQ6PEY2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA3EQ6PEY2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA3EQ6PEY2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA3EQ6PEY2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA3EQ6PEY2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBA3EQ6PEY2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBA3EQ6PEY2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBA3EQ6PEY2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBA3EQ6PEY2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBA3EQ6PEY2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBA3EQ6PEY2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBA3EQ6PEY2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBA3EQ6PEY2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBA3EQ6PEY2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBA3EQ6PEY2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBA3EQ6PEY2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBA3EQ6PEY2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBA3EQ6PEY2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBA3EQ6PEY2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBA3EQ6PEY2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBA3EQ6PEY2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBA3EQ6PEY2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBA3EQ6PEY2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBA3EQ6PEY2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TUBA3EQ6PEY2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TUBA3EQ6PEY2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBA3EQ6PEY2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBA3EQ6PEY2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBA3EQ6PEY2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBA3EQ6PEY2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBA3EQ6PEY2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TUBA3EQ6PEY2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBA3EQ6PEY2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TUBA3EQ6PEY2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBA3EQ6PEY2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBA3EQ6PEY2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBA3EQ6PEY2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBA3EQ6PEY2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TUBA3EQ6PEY2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBA3EQ6PEY2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBA3EQ6PEY2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBA3EQ6PEY2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBA3EQ6PEY2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBA3EQ6PEY2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBA3EQ6PEY2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TUBA3EQ6PEY2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBA3EQ6PEY2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBA3EQ6PEY2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBA3EQ6PEY2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBA3EQ6PEY2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBA3EQ6PEY2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBA3EQ6PEY2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBA3EQ6PEY2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TUBA3EQ6PEY2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBA3EQ6PEY2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBA3EQ6PEY2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TUBA3EQ6PEY2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms