Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD62

CTR9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTR9Q6PD62 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CTR9Q6PD62 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CTR9Q6PD62 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
CTR9Q6PD62 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CTR9Q6PD62 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CTR9Q6PD62 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CTR9Q6PD62 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CTR9Q6PD62 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CTR9Q6PD62 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CTR9Q6PD62 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CTR9Q6PD62 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CTR9Q6PD62 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CTR9Q6PD62 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CTR9Q6PD62 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CTR9Q6PD62 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CTR9Q6PD62 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CTR9Q6PD62 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CTR9Q6PD62 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTR9Q6PD62 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTR9Q6PD62 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTR9Q6PD62 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CTR9Q6PD62 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CTR9Q6PD62 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CTR9Q6PD62 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CTR9Q6PD62 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CTR9Q6PD62 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CTR9Q6PD62 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CTR9Q6PD62 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CTR9Q6PD62 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CTR9Q6PD62 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CTR9Q6PD62 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CTR9Q6PD62 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CTR9Q6PD62 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CTR9Q6PD62 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CTR9Q6PD62 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CTR9Q6PD62 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
CTR9Q6PD62 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CTR9Q6PD62 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CTR9Q6PD62 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CTR9Q6PD62 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CTR9Q6PD62 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CTR9Q6PD62 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CTR9Q6PD62 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CTR9Q6PD62 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CTR9Q6PD62 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CTR9Q6PD62 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CTR9Q6PD62 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CTR9Q6PD62 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CTR9Q6PD62 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CTR9Q6PD62 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CTR9Q6PD62 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CTR9Q6PD62 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CTR9Q6PD62 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CTR9Q6PD62 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CTR9Q6PD62 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CTR9Q6PD62 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CTR9Q6PD62 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CTR9Q6PD62 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CTR9Q6PD62 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CTR9Q6PD62 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CTR9Q6PD62 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CTR9Q6PD62 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CTR9Q6PD62 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CTR9Q6PD62 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CTR9Q6PD62 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CTR9Q6PD62 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CTR9Q6PD62 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CTR9Q6PD62 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CTR9Q6PD62 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CTR9Q6PD62 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CTR9Q6PD62 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CTR9Q6PD62 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CTR9Q6PD62 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CTR9Q6PD62 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CTR9Q6PD62 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTR9Q6PD62 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTR9Q6PD62 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTR9Q6PD62 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTR9Q6PD62 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTR9Q6PD62 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CTR9Q6PD62 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CTR9Q6PD62 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CTR9Q6PD62 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CTR9Q6PD62 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CTR9Q6PD62 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CTR9Q6PD62 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CTR9Q6PD62 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CTR9Q6PD62 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CTR9Q6PD62 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CTR9Q6PD62 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CTR9Q6PD62 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CTR9Q6PD62 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CTR9Q6PD62 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CTR9Q6PD62 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CTR9Q6PD62 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CTR9Q6PD62 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CTR9Q6PD62 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CTR9Q6PD62 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CTR9Q6PD62 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CTR9Q6PD62 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms