Protein–RNA interactions for Protein: Q6P597

KLC3, Kinesin light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLC3Q6P597 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLC3Q6P597 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLC3Q6P597 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KLC3Q6P597 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLC3Q6P597 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLC3Q6P597 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLC3Q6P597 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLC3Q6P597 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLC3Q6P597 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLC3Q6P597 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLC3Q6P597 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLC3Q6P597 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KLC3Q6P597 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLC3Q6P597 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLC3Q6P597 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLC3Q6P597 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLC3Q6P597 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLC3Q6P597 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLC3Q6P597 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLC3Q6P597 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLC3Q6P597 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLC3Q6P597 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLC3Q6P597 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLC3Q6P597 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLC3Q6P597 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLC3Q6P597 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLC3Q6P597 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLC3Q6P597 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLC3Q6P597 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLC3Q6P597 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLC3Q6P597 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLC3Q6P597 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLC3Q6P597 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLC3Q6P597 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLC3Q6P597 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLC3Q6P597 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLC3Q6P597 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLC3Q6P597 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLC3Q6P597 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KLC3Q6P597 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
KLC3Q6P597 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLC3Q6P597 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLC3Q6P597 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KLC3Q6P597 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLC3Q6P597 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KLC3Q6P597 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLC3Q6P597 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLC3Q6P597 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLC3Q6P597 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLC3Q6P597 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLC3Q6P597 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLC3Q6P597 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLC3Q6P597 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLC3Q6P597 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLC3Q6P597 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLC3Q6P597 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLC3Q6P597 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLC3Q6P597 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLC3Q6P597 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
KLC3Q6P597 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLC3Q6P597 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLC3Q6P597 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLC3Q6P597 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
KLC3Q6P597 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
KLC3Q6P597 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLC3Q6P597 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLC3Q6P597 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLC3Q6P597 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLC3Q6P597 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLC3Q6P597 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLC3Q6P597 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLC3Q6P597 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLC3Q6P597 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLC3Q6P597 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLC3Q6P597 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLC3Q6P597 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLC3Q6P597 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLC3Q6P597 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLC3Q6P597 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLC3Q6P597 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLC3Q6P597 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLC3Q6P597 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLC3Q6P597 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLC3Q6P597 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLC3Q6P597 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLC3Q6P597 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLC3Q6P597 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
KLC3Q6P597 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLC3Q6P597 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KLC3Q6P597 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLC3Q6P597 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLC3Q6P597 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLC3Q6P597 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLC3Q6P597 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLC3Q6P597 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLC3Q6P597 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLC3Q6P597 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLC3Q6P597 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLC3Q6P597 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KLC3Q6P597 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 303 ms