Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNNM4Q6P4Q7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNNM4Q6P4Q7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNNM4Q6P4Q7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNNM4Q6P4Q7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNNM4Q6P4Q7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNNM4Q6P4Q7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNNM4Q6P4Q7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNNM4Q6P4Q7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CNNM4Q6P4Q7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNNM4Q6P4Q7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNNM4Q6P4Q7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNNM4Q6P4Q7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNNM4Q6P4Q7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNNM4Q6P4Q7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNNM4Q6P4Q7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNNM4Q6P4Q7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNNM4Q6P4Q7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNNM4Q6P4Q7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNNM4Q6P4Q7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNNM4Q6P4Q7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNNM4Q6P4Q7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CNNM4Q6P4Q7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNNM4Q6P4Q7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNNM4Q6P4Q7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNNM4Q6P4Q7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNNM4Q6P4Q7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNNM4Q6P4Q7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNNM4Q6P4Q7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNNM4Q6P4Q7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNNM4Q6P4Q7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNNM4Q6P4Q7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNNM4Q6P4Q7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CNNM4Q6P4Q7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNNM4Q6P4Q7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CNNM4Q6P4Q7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNNM4Q6P4Q7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNNM4Q6P4Q7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNNM4Q6P4Q7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNNM4Q6P4Q7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNNM4Q6P4Q7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNNM4Q6P4Q7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNNM4Q6P4Q7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CNNM4Q6P4Q7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CNNM4Q6P4Q7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CNNM4Q6P4Q7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNNM4Q6P4Q7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNNM4Q6P4Q7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNNM4Q6P4Q7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNNM4Q6P4Q7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CNNM4Q6P4Q7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNNM4Q6P4Q7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNNM4Q6P4Q7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNNM4Q6P4Q7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNNM4Q6P4Q7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNNM4Q6P4Q7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CNNM4Q6P4Q7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNNM4Q6P4Q7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNNM4Q6P4Q7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNNM4Q6P4Q7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNNM4Q6P4Q7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNNM4Q6P4Q7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CNNM4Q6P4Q7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CNNM4Q6P4Q7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms