Protein–RNA interactions for Protein: Q6EEV6

SUMO4, Small ubiquitin-related modifier 4, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO4Q6EEV6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SUMO4Q6EEV6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SUMO4Q6EEV6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SUMO4Q6EEV6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SUMO4Q6EEV6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SUMO4Q6EEV6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUMO4Q6EEV6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUMO4Q6EEV6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUMO4Q6EEV6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SUMO4Q6EEV6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUMO4Q6EEV6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUMO4Q6EEV6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUMO4Q6EEV6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUMO4Q6EEV6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SUMO4Q6EEV6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUMO4Q6EEV6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUMO4Q6EEV6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUMO4Q6EEV6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUMO4Q6EEV6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUMO4Q6EEV6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SUMO4Q6EEV6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUMO4Q6EEV6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SUMO4Q6EEV6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SUMO4Q6EEV6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SUMO4Q6EEV6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUMO4Q6EEV6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUMO4Q6EEV6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUMO4Q6EEV6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SUMO4Q6EEV6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUMO4Q6EEV6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUMO4Q6EEV6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUMO4Q6EEV6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SUMO4Q6EEV6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SUMO4Q6EEV6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SUMO4Q6EEV6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SUMO4Q6EEV6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SUMO4Q6EEV6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SUMO4Q6EEV6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SUMO4Q6EEV6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SUMO4Q6EEV6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SUMO4Q6EEV6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SUMO4Q6EEV6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SUMO4Q6EEV6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUMO4Q6EEV6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUMO4Q6EEV6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUMO4Q6EEV6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUMO4Q6EEV6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUMO4Q6EEV6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUMO4Q6EEV6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUMO4Q6EEV6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SUMO4Q6EEV6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUMO4Q6EEV6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUMO4Q6EEV6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SUMO4Q6EEV6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUMO4Q6EEV6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SUMO4Q6EEV6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUMO4Q6EEV6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUMO4Q6EEV6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUMO4Q6EEV6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUMO4Q6EEV6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUMO4Q6EEV6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SUMO4Q6EEV6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms