Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALS2CLQ60I27 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALS2CLQ60I27 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ALS2CLQ60I27 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALS2CLQ60I27 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ALS2CLQ60I27 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
ALS2CLQ60I27 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALS2CLQ60I27 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALS2CLQ60I27 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ALS2CLQ60I27 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ALS2CLQ60I27 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALS2CLQ60I27 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALS2CLQ60I27 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALS2CLQ60I27 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALS2CLQ60I27 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ALS2CLQ60I27 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ALS2CLQ60I27 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALS2CLQ60I27 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALS2CLQ60I27 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALS2CLQ60I27 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ALS2CLQ60I27 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALS2CLQ60I27 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ALS2CLQ60I27 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALS2CLQ60I27 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ALS2CLQ60I27 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALS2CLQ60I27 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ALS2CLQ60I27 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ALS2CLQ60I27 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALS2CLQ60I27 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ALS2CLQ60I27 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALS2CLQ60I27 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALS2CLQ60I27 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALS2CLQ60I27 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALS2CLQ60I27 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALS2CLQ60I27 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALS2CLQ60I27 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALS2CLQ60I27 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALS2CLQ60I27 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ALS2CLQ60I27 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALS2CLQ60I27 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALS2CLQ60I27 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALS2CLQ60I27 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALS2CLQ60I27 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALS2CLQ60I27 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALS2CLQ60I27 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALS2CLQ60I27 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ALS2CLQ60I27 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ALS2CLQ60I27 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALS2CLQ60I27 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ALS2CLQ60I27 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALS2CLQ60I27 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALS2CLQ60I27 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ALS2CLQ60I27 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALS2CLQ60I27 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ALS2CLQ60I27 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALS2CLQ60I27 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ALS2CLQ60I27 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALS2CLQ60I27 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALS2CLQ60I27 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ALS2CLQ60I27 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALS2CLQ60I27 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALS2CLQ60I27 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALS2CLQ60I27 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ALS2CLQ60I27 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms