Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
CARMIL1Q5VZK9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC41.3■■■■■ 4.2
CARMIL1Q5VZK9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC41.29■■■■■ 4.2
CARMIL1Q5VZK9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC41.29■■■■■ 4.2
CARMIL1Q5VZK9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
CARMIL1Q5VZK9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
CARMIL1Q5VZK9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC41.28■■■■■ 4.2
CARMIL1Q5VZK9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
CARMIL1Q5VZK9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
CARMIL1Q5VZK9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC41.28■■■■■ 4.2
CARMIL1Q5VZK9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
CARMIL1Q5VZK9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CARMIL1Q5VZK9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CARMIL1Q5VZK9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
CARMIL1Q5VZK9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CARMIL1Q5VZK9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CARMIL1Q5VZK9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
CARMIL1Q5VZK9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
CARMIL1Q5VZK9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
CARMIL1Q5VZK9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC41.25■■■■■ 4.19
CARMIL1Q5VZK9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
CARMIL1Q5VZK9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
CARMIL1Q5VZK9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
CARMIL1Q5VZK9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
CARMIL1Q5VZK9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
CARMIL1Q5VZK9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
CARMIL1Q5VZK9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
CARMIL1Q5VZK9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
CARMIL1Q5VZK9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
CARMIL1Q5VZK9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
CARMIL1Q5VZK9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
CARMIL1Q5VZK9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
CARMIL1Q5VZK9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
CARMIL1Q5VZK9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
CARMIL1Q5VZK9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
CARMIL1Q5VZK9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
CARMIL1Q5VZK9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
CARMIL1Q5VZK9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.21■■■■■ 4.19
CARMIL1Q5VZK9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC41.19■■■■■ 4.18
CARMIL1Q5VZK9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
CARMIL1Q5VZK9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC41.19■■■■■ 4.18
CARMIL1Q5VZK9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
CARMIL1Q5VZK9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC41.18■■■■■ 4.18
CARMIL1Q5VZK9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
CARMIL1Q5VZK9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CARMIL1Q5VZK9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
CARMIL1Q5VZK9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
CARMIL1Q5VZK9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CARMIL1Q5VZK9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
CARMIL1Q5VZK9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CARMIL1Q5VZK9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.15■■■■■ 4.18
CARMIL1Q5VZK9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
CARMIL1Q5VZK9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
CARMIL1Q5VZK9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
CARMIL1Q5VZK9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC41.12■■■■■ 4.17
CARMIL1Q5VZK9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
CARMIL1Q5VZK9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
CARMIL1Q5VZK9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
CARMIL1Q5VZK9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
CARMIL1Q5VZK9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CARMIL1Q5VZK9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
CARMIL1Q5VZK9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
CARMIL1Q5VZK9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
CARMIL1Q5VZK9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
CARMIL1Q5VZK9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
CARMIL1Q5VZK9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
CARMIL1Q5VZK9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CARMIL1Q5VZK9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CARMIL1Q5VZK9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
CARMIL1Q5VZK9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
CARMIL1Q5VZK9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.07■■■■■ 4.16
CARMIL1Q5VZK9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.16
CARMIL1Q5VZK9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.16
CARMIL1Q5VZK9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.16
CARMIL1Q5VZK9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
CARMIL1Q5VZK9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
CARMIL1Q5VZK9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
CARMIL1Q5VZK9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC41.05■■■■■ 4.16
CARMIL1Q5VZK9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
CARMIL1Q5VZK9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
CARMIL1Q5VZK9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC41.05■■■■■ 4.16
CARMIL1Q5VZK9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
CARMIL1Q5VZK9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
CARMIL1Q5VZK9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
CARMIL1Q5VZK9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
CARMIL1Q5VZK9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC41.03■■■■■ 4.16
CARMIL1Q5VZK9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC41.03■■■■■ 4.16
CARMIL1Q5VZK9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC41.01■■■■■ 4.16
CARMIL1Q5VZK9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
CARMIL1Q5VZK9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
CARMIL1Q5VZK9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC41■■■■■ 4.15
CARMIL1Q5VZK9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
CARMIL1Q5VZK9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CARMIL1Q5VZK9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.99■■■■■ 4.15
CARMIL1Q5VZK9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC40.99■■■■■ 4.15
CARMIL1Q5VZK9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
CARMIL1Q5VZK9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
CARMIL1Q5VZK9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
CARMIL1Q5VZK9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
CARMIL1Q5VZK9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms