Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHEQ5VZ18 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHEQ5VZ18 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHEQ5VZ18 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHEQ5VZ18 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHEQ5VZ18 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHEQ5VZ18 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHEQ5VZ18 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHEQ5VZ18 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHEQ5VZ18 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SHEQ5VZ18 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SHEQ5VZ18 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHEQ5VZ18 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHEQ5VZ18 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHEQ5VZ18 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHEQ5VZ18 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SHEQ5VZ18 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHEQ5VZ18 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHEQ5VZ18 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHEQ5VZ18 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHEQ5VZ18 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHEQ5VZ18 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SHEQ5VZ18 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHEQ5VZ18 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHEQ5VZ18 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SHEQ5VZ18 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SHEQ5VZ18 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHEQ5VZ18 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHEQ5VZ18 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHEQ5VZ18 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHEQ5VZ18 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SHEQ5VZ18 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHEQ5VZ18 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHEQ5VZ18 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHEQ5VZ18 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SHEQ5VZ18 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHEQ5VZ18 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHEQ5VZ18 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SHEQ5VZ18 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHEQ5VZ18 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHEQ5VZ18 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHEQ5VZ18 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHEQ5VZ18 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SHEQ5VZ18 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SHEQ5VZ18 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SHEQ5VZ18 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms