Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACHD1Q5VU97 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACHD1Q5VU97 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACHD1Q5VU97 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACHD1Q5VU97 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACHD1Q5VU97 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACHD1Q5VU97 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CACHD1Q5VU97 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CACHD1Q5VU97 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACHD1Q5VU97 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACHD1Q5VU97 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CACHD1Q5VU97 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACHD1Q5VU97 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACHD1Q5VU97 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACHD1Q5VU97 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACHD1Q5VU97 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACHD1Q5VU97 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACHD1Q5VU97 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CACHD1Q5VU97 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACHD1Q5VU97 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACHD1Q5VU97 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACHD1Q5VU97 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CACHD1Q5VU97 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACHD1Q5VU97 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CACHD1Q5VU97 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACHD1Q5VU97 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACHD1Q5VU97 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CACHD1Q5VU97 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACHD1Q5VU97 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CACHD1Q5VU97 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACHD1Q5VU97 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACHD1Q5VU97 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACHD1Q5VU97 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACHD1Q5VU97 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACHD1Q5VU97 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CACHD1Q5VU97 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CACHD1Q5VU97 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CACHD1Q5VU97 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACHD1Q5VU97 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACHD1Q5VU97 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACHD1Q5VU97 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CACHD1Q5VU97 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CACHD1Q5VU97 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACHD1Q5VU97 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACHD1Q5VU97 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACHD1Q5VU97 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CACHD1Q5VU97 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACHD1Q5VU97 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACHD1Q5VU97 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CACHD1Q5VU97 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACHD1Q5VU97 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACHD1Q5VU97 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CACHD1Q5VU97 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACHD1Q5VU97 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACHD1Q5VU97 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CACHD1Q5VU97 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACHD1Q5VU97 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACHD1Q5VU97 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACHD1Q5VU97 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACHD1Q5VU97 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CACHD1Q5VU97 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACHD1Q5VU97 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACHD1Q5VU97 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CACHD1Q5VU97 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
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