Protein–RNA interactions for Protein: Q5TCQ9

MAGI3, Membrane-associated guanylate kinase, WW and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGI3Q5TCQ9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
MAGI3Q5TCQ9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
MAGI3Q5TCQ9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
MAGI3Q5TCQ9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
MAGI3Q5TCQ9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
MAGI3Q5TCQ9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
MAGI3Q5TCQ9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
MAGI3Q5TCQ9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
MAGI3Q5TCQ9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
MAGI3Q5TCQ9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
MAGI3Q5TCQ9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC39.45■■■■□ 3.91
MAGI3Q5TCQ9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC39.45■■■■□ 3.91
MAGI3Q5TCQ9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
MAGI3Q5TCQ9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
MAGI3Q5TCQ9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
MAGI3Q5TCQ9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
MAGI3Q5TCQ9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
MAGI3Q5TCQ9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
MAGI3Q5TCQ9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
MAGI3Q5TCQ9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
MAGI3Q5TCQ9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
MAGI3Q5TCQ9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
MAGI3Q5TCQ9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
MAGI3Q5TCQ9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
MAGI3Q5TCQ9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
MAGI3Q5TCQ9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
MAGI3Q5TCQ9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
MAGI3Q5TCQ9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
MAGI3Q5TCQ9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
MAGI3Q5TCQ9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
MAGI3Q5TCQ9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
MAGI3Q5TCQ9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
MAGI3Q5TCQ9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
MAGI3Q5TCQ9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
MAGI3Q5TCQ9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC39.39■■■■□ 3.9
MAGI3Q5TCQ9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC39.38■■■■□ 3.89
MAGI3Q5TCQ9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
MAGI3Q5TCQ9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC39.38■■■■□ 3.89
MAGI3Q5TCQ9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC39.38■■■■□ 3.89
MAGI3Q5TCQ9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
MAGI3Q5TCQ9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
MAGI3Q5TCQ9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
MAGI3Q5TCQ9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
MAGI3Q5TCQ9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
MAGI3Q5TCQ9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
MAGI3Q5TCQ9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
MAGI3Q5TCQ9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
MAGI3Q5TCQ9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
MAGI3Q5TCQ9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
MAGI3Q5TCQ9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
MAGI3Q5TCQ9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
MAGI3Q5TCQ9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
MAGI3Q5TCQ9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
MAGI3Q5TCQ9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
MAGI3Q5TCQ9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC39.33■■■■□ 3.89
MAGI3Q5TCQ9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC39.32■■■■□ 3.89
MAGI3Q5TCQ9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
MAGI3Q5TCQ9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
MAGI3Q5TCQ9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
MAGI3Q5TCQ9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
MAGI3Q5TCQ9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
MAGI3Q5TCQ9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
MAGI3Q5TCQ9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
MAGI3Q5TCQ9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
MAGI3Q5TCQ9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
MAGI3Q5TCQ9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC39.29■■■■□ 3.88
MAGI3Q5TCQ9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
MAGI3Q5TCQ9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
MAGI3Q5TCQ9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
MAGI3Q5TCQ9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
MAGI3Q5TCQ9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
MAGI3Q5TCQ9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
MAGI3Q5TCQ9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
MAGI3Q5TCQ9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC39.27■■■■□ 3.88
MAGI3Q5TCQ9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
MAGI3Q5TCQ9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
MAGI3Q5TCQ9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
MAGI3Q5TCQ9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.87
MAGI3Q5TCQ9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
MAGI3Q5TCQ9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
MAGI3Q5TCQ9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
MAGI3Q5TCQ9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
MAGI3Q5TCQ9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
MAGI3Q5TCQ9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
MAGI3Q5TCQ9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
MAGI3Q5TCQ9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC39.23■■■■□ 3.87
MAGI3Q5TCQ9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
MAGI3Q5TCQ9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
MAGI3Q5TCQ9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
MAGI3Q5TCQ9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
MAGI3Q5TCQ9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
MAGI3Q5TCQ9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
MAGI3Q5TCQ9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
MAGI3Q5TCQ9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.21■■■■□ 3.87
MAGI3Q5TCQ9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
MAGI3Q5TCQ9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
MAGI3Q5TCQ9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
MAGI3Q5TCQ9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
MAGI3Q5TCQ9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
MAGI3Q5TCQ9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC39.19■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms