Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
SAMD9Q5K651 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
SAMD9Q5K651 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
SAMD9Q5K651 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
SAMD9Q5K651 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
SAMD9Q5K651 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.16■■■■■ 4.02
SAMD9Q5K651 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
SAMD9Q5K651 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
SAMD9Q5K651 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
SAMD9Q5K651 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
SAMD9Q5K651 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
SAMD9Q5K651 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
SAMD9Q5K651 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.14■■■■■ 4.02
SAMD9Q5K651 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC40.14■■■■■ 4.02
SAMD9Q5K651 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
SAMD9Q5K651 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
SAMD9Q5K651 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.02
SAMD9Q5K651 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC40.13■■■■■ 4.02
SAMD9Q5K651 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
SAMD9Q5K651 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
SAMD9Q5K651 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
SAMD9Q5K651 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC40.11■■■■■ 4.01
SAMD9Q5K651 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
SAMD9Q5K651 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
SAMD9Q5K651 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
SAMD9Q5K651 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
SAMD9Q5K651 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
SAMD9Q5K651 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
SAMD9Q5K651 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
SAMD9Q5K651 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
SAMD9Q5K651 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC40.08■■■■■ 4.01
SAMD9Q5K651 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
SAMD9Q5K651 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
SAMD9Q5K651 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
SAMD9Q5K651 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
SAMD9Q5K651 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4.01
SAMD9Q5K651 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
SAMD9Q5K651 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
SAMD9Q5K651 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC40.06■■■■■ 4
SAMD9Q5K651 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
SAMD9Q5K651 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
SAMD9Q5K651 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
SAMD9Q5K651 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
SAMD9Q5K651 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
SAMD9Q5K651 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
SAMD9Q5K651 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
SAMD9Q5K651 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
SAMD9Q5K651 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
SAMD9Q5K651 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC40.04■■■■■ 4
SAMD9Q5K651 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
SAMD9Q5K651 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC40.04■■■■■ 4
SAMD9Q5K651 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC40.03■■■■■ 4
SAMD9Q5K651 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC40.03■■■■■ 4
SAMD9Q5K651 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
SAMD9Q5K651 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
SAMD9Q5K651 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.02■■■■■ 4
SAMD9Q5K651 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
SAMD9Q5K651 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC40.02■■■■■ 4
SAMD9Q5K651 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
SAMD9Q5K651 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.01■■■■■ 4
SAMD9Q5K651 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
SAMD9Q5K651 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC40■■■■□ 3.99
SAMD9Q5K651 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40■■■■□ 3.99
SAMD9Q5K651 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
SAMD9Q5K651 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
SAMD9Q5K651 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
SAMD9Q5K651 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC39.98■■■■□ 3.99
SAMD9Q5K651 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
SAMD9Q5K651 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.97■■■■□ 3.99
SAMD9Q5K651 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.97■■■■□ 3.99
SAMD9Q5K651 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
SAMD9Q5K651 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.96■■■■□ 3.99
SAMD9Q5K651 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
SAMD9Q5K651 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
SAMD9Q5K651 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
SAMD9Q5K651 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
SAMD9Q5K651 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
SAMD9Q5K651 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC39.93■■■■□ 3.98
SAMD9Q5K651 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
SAMD9Q5K651 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC39.93■■■■□ 3.98
SAMD9Q5K651 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC39.93■■■■□ 3.98
SAMD9Q5K651 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC39.92■■■■□ 3.98
SAMD9Q5K651 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC39.92■■■■□ 3.98
SAMD9Q5K651 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
SAMD9Q5K651 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
SAMD9Q5K651 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC39.9■■■■□ 3.98
SAMD9Q5K651 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
SAMD9Q5K651 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
SAMD9Q5K651 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
SAMD9Q5K651 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC39.89■■■■□ 3.98
SAMD9Q5K651 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC39.89■■■■□ 3.98
SAMD9Q5K651 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.97
SAMD9Q5K651 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
SAMD9Q5K651 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
SAMD9Q5K651 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC39.87■■■■□ 3.97
SAMD9Q5K651 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
SAMD9Q5K651 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
SAMD9Q5K651 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
SAMD9Q5K651 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
SAMD9Q5K651 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC39.86■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms