Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FGD3Q5JSP0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FGD3Q5JSP0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FGD3Q5JSP0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FGD3Q5JSP0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD3Q5JSP0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD3Q5JSP0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD3Q5JSP0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD3Q5JSP0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FGD3Q5JSP0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGD3Q5JSP0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FGD3Q5JSP0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD3Q5JSP0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD3Q5JSP0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD3Q5JSP0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD3Q5JSP0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FGD3Q5JSP0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD3Q5JSP0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD3Q5JSP0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD3Q5JSP0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FGD3Q5JSP0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD3Q5JSP0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD3Q5JSP0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD3Q5JSP0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD3Q5JSP0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FGD3Q5JSP0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD3Q5JSP0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD3Q5JSP0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD3Q5JSP0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD3Q5JSP0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FGD3Q5JSP0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms