Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYW3

RTL5, Retrotransposon Gag-like protein 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 569 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL5Q5HYW3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RTL5Q5HYW3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RTL5Q5HYW3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RTL5Q5HYW3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RTL5Q5HYW3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RTL5Q5HYW3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RTL5Q5HYW3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RTL5Q5HYW3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RTL5Q5HYW3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RTL5Q5HYW3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RTL5Q5HYW3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RTL5Q5HYW3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
RTL5Q5HYW3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RTL5Q5HYW3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RTL5Q5HYW3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RTL5Q5HYW3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
RTL5Q5HYW3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RTL5Q5HYW3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RTL5Q5HYW3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RTL5Q5HYW3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RTL5Q5HYW3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RTL5Q5HYW3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RTL5Q5HYW3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RTL5Q5HYW3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RTL5Q5HYW3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RTL5Q5HYW3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RTL5Q5HYW3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RTL5Q5HYW3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RTL5Q5HYW3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RTL5Q5HYW3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RTL5Q5HYW3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
RTL5Q5HYW3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RTL5Q5HYW3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RTL5Q5HYW3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RTL5Q5HYW3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RTL5Q5HYW3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RTL5Q5HYW3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RTL5Q5HYW3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
RTL5Q5HYW3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
RTL5Q5HYW3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
RTL5Q5HYW3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RTL5Q5HYW3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RTL5Q5HYW3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RTL5Q5HYW3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RTL5Q5HYW3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
RTL5Q5HYW3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RTL5Q5HYW3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RTL5Q5HYW3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RTL5Q5HYW3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RTL5Q5HYW3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
RTL5Q5HYW3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RTL5Q5HYW3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
RTL5Q5HYW3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RTL5Q5HYW3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RTL5Q5HYW3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RTL5Q5HYW3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RTL5Q5HYW3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RTL5Q5HYW3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
RTL5Q5HYW3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RTL5Q5HYW3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RTL5Q5HYW3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
RTL5Q5HYW3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RTL5Q5HYW3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
RTL5Q5HYW3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
RTL5Q5HYW3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
RTL5Q5HYW3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RTL5Q5HYW3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RTL5Q5HYW3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RTL5Q5HYW3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
RTL5Q5HYW3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
RTL5Q5HYW3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
RTL5Q5HYW3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
RTL5Q5HYW3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
RTL5Q5HYW3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
RTL5Q5HYW3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RTL5Q5HYW3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RTL5Q5HYW3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RTL5Q5HYW3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RTL5Q5HYW3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
RTL5Q5HYW3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
RTL5Q5HYW3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RTL5Q5HYW3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RTL5Q5HYW3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RTL5Q5HYW3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
RTL5Q5HYW3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RTL5Q5HYW3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RTL5Q5HYW3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RTL5Q5HYW3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RTL5Q5HYW3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RTL5Q5HYW3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
RTL5Q5HYW3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
RTL5Q5HYW3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
RTL5Q5HYW3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RTL5Q5HYW3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
RTL5Q5HYW3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
RTL5Q5HYW3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
RTL5Q5HYW3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
RTL5Q5HYW3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
RTL5Q5HYW3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.7
RTL5Q5HYW3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms