Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CMPK2Q5EBM0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CMPK2Q5EBM0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CMPK2Q5EBM0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CMPK2Q5EBM0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CMPK2Q5EBM0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CMPK2Q5EBM0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CMPK2Q5EBM0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CMPK2Q5EBM0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CMPK2Q5EBM0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CMPK2Q5EBM0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CMPK2Q5EBM0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CMPK2Q5EBM0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CMPK2Q5EBM0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CMPK2Q5EBM0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CMPK2Q5EBM0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CMPK2Q5EBM0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CMPK2Q5EBM0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CMPK2Q5EBM0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CMPK2Q5EBM0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CMPK2Q5EBM0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CMPK2Q5EBM0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CMPK2Q5EBM0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CMPK2Q5EBM0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CMPK2Q5EBM0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CMPK2Q5EBM0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CMPK2Q5EBM0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CMPK2Q5EBM0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CMPK2Q5EBM0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CMPK2Q5EBM0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMPK2Q5EBM0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMPK2Q5EBM0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMPK2Q5EBM0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMPK2Q5EBM0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMPK2Q5EBM0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CMPK2Q5EBM0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CMPK2Q5EBM0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CMPK2Q5EBM0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CMPK2Q5EBM0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CMPK2Q5EBM0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CMPK2Q5EBM0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CMPK2Q5EBM0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CMPK2Q5EBM0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CMPK2Q5EBM0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CMPK2Q5EBM0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CMPK2Q5EBM0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CMPK2Q5EBM0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CMPK2Q5EBM0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CMPK2Q5EBM0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CMPK2Q5EBM0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CMPK2Q5EBM0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CMPK2Q5EBM0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CMPK2Q5EBM0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CMPK2Q5EBM0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CMPK2Q5EBM0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CMPK2Q5EBM0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CMPK2Q5EBM0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CMPK2Q5EBM0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CMPK2Q5EBM0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms