Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ANKRD39Q53RE8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ANKRD39Q53RE8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ANKRD39Q53RE8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms