Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GREB1Q4ZG55 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GREB1Q4ZG55 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GREB1Q4ZG55 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GREB1Q4ZG55 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GREB1Q4ZG55 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GREB1Q4ZG55 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GREB1Q4ZG55 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GREB1Q4ZG55 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GREB1Q4ZG55 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GREB1Q4ZG55 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GREB1Q4ZG55 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GREB1Q4ZG55 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GREB1Q4ZG55 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GREB1Q4ZG55 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GREB1Q4ZG55 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GREB1Q4ZG55 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GREB1Q4ZG55 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GREB1Q4ZG55 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GREB1Q4ZG55 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.8
GREB1Q4ZG55 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GREB1Q4ZG55 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GREB1Q4ZG55 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GREB1Q4ZG55 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GREB1Q4ZG55 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GREB1Q4ZG55 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GREB1Q4ZG55 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GREB1Q4ZG55 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GREB1Q4ZG55 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GREB1Q4ZG55 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GREB1Q4ZG55 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GREB1Q4ZG55 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GREB1Q4ZG55 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
GREB1Q4ZG55 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GREB1Q4ZG55 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GREB1Q4ZG55 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GREB1Q4ZG55 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GREB1Q4ZG55 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GREB1Q4ZG55 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GREB1Q4ZG55 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GREB1Q4ZG55 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GREB1Q4ZG55 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GREB1Q4ZG55 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GREB1Q4ZG55 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GREB1Q4ZG55 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GREB1Q4ZG55 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GREB1Q4ZG55 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GREB1Q4ZG55 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GREB1Q4ZG55 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GREB1Q4ZG55 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GREB1Q4ZG55 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GREB1Q4ZG55 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GREB1Q4ZG55 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GREB1Q4ZG55 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GREB1Q4ZG55 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GREB1Q4ZG55 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GREB1Q4ZG55 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GREB1Q4ZG55 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GREB1Q4ZG55 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GREB1Q4ZG55 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GREB1Q4ZG55 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GREB1Q4ZG55 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GREB1Q4ZG55 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GREB1Q4ZG55 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GREB1Q4ZG55 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GREB1Q4ZG55 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GREB1Q4ZG55 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GREB1Q4ZG55 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
GREB1Q4ZG55 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GREB1Q4ZG55 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GREB1Q4ZG55 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GREB1Q4ZG55 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GREB1Q4ZG55 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GREB1Q4ZG55 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GREB1Q4ZG55 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GREB1Q4ZG55 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GREB1Q4ZG55 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GREB1Q4ZG55 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GREB1Q4ZG55 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GREB1Q4ZG55 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GREB1Q4ZG55 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GREB1Q4ZG55 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GREB1Q4ZG55 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GREB1Q4ZG55 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GREB1Q4ZG55 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GREB1Q4ZG55 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GREB1Q4ZG55 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GREB1Q4ZG55 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GREB1Q4ZG55 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GREB1Q4ZG55 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GREB1Q4ZG55 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
GREB1Q4ZG55 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GREB1Q4ZG55 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
GREB1Q4ZG55 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
GREB1Q4ZG55 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GREB1Q4ZG55 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GREB1Q4ZG55 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GREB1Q4ZG55 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GREB1Q4ZG55 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GREB1Q4ZG55 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms