Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN0

KRTAP25-1, Keratin-associated protein 25-1, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP25-1Q3LHN0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
KRTAP25-1Q3LHN0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
KRTAP25-1Q3LHN0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP25-1Q3LHN0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms