Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CCDC96Q2M329 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC96Q2M329 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC96Q2M329 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC96Q2M329 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC96Q2M329 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CCDC96Q2M329 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CCDC96Q2M329 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC96Q2M329 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC96Q2M329 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC96Q2M329 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC96Q2M329 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC96Q2M329 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC96Q2M329 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC96Q2M329 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CCDC96Q2M329 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CCDC96Q2M329 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC96Q2M329 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC96Q2M329 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC96Q2M329 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC96Q2M329 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC96Q2M329 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC96Q2M329 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC96Q2M329 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC96Q2M329 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CCDC96Q2M329 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC96Q2M329 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC96Q2M329 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CCDC96Q2M329 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC96Q2M329 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC96Q2M329 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CCDC96Q2M329 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CCDC96Q2M329 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC96Q2M329 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC96Q2M329 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC96Q2M329 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC96Q2M329 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC96Q2M329 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC96Q2M329 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC96Q2M329 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC96Q2M329 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC96Q2M329 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC96Q2M329 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC96Q2M329 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC96Q2M329 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC96Q2M329 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC96Q2M329 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC96Q2M329 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC96Q2M329 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC96Q2M329 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC96Q2M329 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC96Q2M329 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC96Q2M329 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC96Q2M329 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC96Q2M329 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC96Q2M329 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC96Q2M329 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC96Q2M329 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC96Q2M329 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC96Q2M329 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC96Q2M329 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC96Q2M329 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC96Q2M329 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC96Q2M329 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC96Q2M329 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC96Q2M329 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC96Q2M329 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC96Q2M329 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC96Q2M329 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC96Q2M329 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC96Q2M329 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC96Q2M329 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC96Q2M329 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC96Q2M329 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC96Q2M329 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC96Q2M329 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC96Q2M329 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC96Q2M329 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC96Q2M329 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC96Q2M329 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC96Q2M329 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC96Q2M329 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC96Q2M329 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC96Q2M329 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC96Q2M329 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC96Q2M329 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC96Q2M329 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC96Q2M329 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC96Q2M329 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC96Q2M329 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC96Q2M329 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC96Q2M329 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC96Q2M329 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC96Q2M329 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC96Q2M329 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC96Q2M329 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC96Q2M329 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC96Q2M329 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC96Q2M329 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC96Q2M329 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms