Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDR2Q16832 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDR2Q16832 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DDR2Q16832 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDR2Q16832 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DDR2Q16832 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDR2Q16832 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DDR2Q16832 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DDR2Q16832 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DDR2Q16832 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DDR2Q16832 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DDR2Q16832 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DDR2Q16832 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DDR2Q16832 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDR2Q16832 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDR2Q16832 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDR2Q16832 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDR2Q16832 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDR2Q16832 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DDR2Q16832 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDR2Q16832 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDR2Q16832 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDR2Q16832 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDR2Q16832 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDR2Q16832 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DDR2Q16832 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDR2Q16832 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDR2Q16832 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDR2Q16832 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDR2Q16832 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
DDR2Q16832 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
DDR2Q16832 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
DDR2Q16832 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DDR2Q16832 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDR2Q16832 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDR2Q16832 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
DDR2Q16832 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDR2Q16832 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
DDR2Q16832 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
DDR2Q16832 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDR2Q16832 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
DDR2Q16832 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDR2Q16832 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDR2Q16832 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDR2Q16832 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
DDR2Q16832 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDR2Q16832 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDR2Q16832 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
DDR2Q16832 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDR2Q16832 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDR2Q16832 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDR2Q16832 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DDR2Q16832 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDR2Q16832 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDR2Q16832 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
DDR2Q16832 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDR2Q16832 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DDR2Q16832 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
DDR2Q16832 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDR2Q16832 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDR2Q16832 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDR2Q16832 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
DDR2Q16832 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
DDR2Q16832 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DDR2Q16832 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DDR2Q16832 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDR2Q16832 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDR2Q16832 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDR2Q16832 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDR2Q16832 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDR2Q16832 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDR2Q16832 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDR2Q16832 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DDR2Q16832 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDR2Q16832 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDR2Q16832 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDR2Q16832 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDR2Q16832 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDR2Q16832 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DDR2Q16832 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDR2Q16832 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDR2Q16832 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDR2Q16832 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DDR2Q16832 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
DDR2Q16832 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
DDR2Q16832 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDR2Q16832 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDR2Q16832 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DDR2Q16832 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
DDR2Q16832 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDR2Q16832 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDR2Q16832 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDR2Q16832 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDR2Q16832 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DDR2Q16832 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDR2Q16832 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDR2Q16832 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDR2Q16832 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DDR2Q16832 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DDR2Q16832 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms