Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNMB1Q16558 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KCNMB1Q16558 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNMB1Q16558 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNMB1Q16558 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KCNMB1Q16558 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNMB1Q16558 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
KCNMB1Q16558 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNMB1Q16558 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNMB1Q16558 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNMB1Q16558 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNMB1Q16558 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNMB1Q16558 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNMB1Q16558 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNMB1Q16558 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNMB1Q16558 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNMB1Q16558 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
KCNMB1Q16558 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMB1Q16558 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMB1Q16558 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMB1Q16558 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMB1Q16558 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KCNMB1Q16558 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KCNMB1Q16558 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNMB1Q16558 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNMB1Q16558 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNMB1Q16558 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNMB1Q16558 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNMB1Q16558 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
KCNMB1Q16558 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMB1Q16558 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMB1Q16558 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMB1Q16558 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMB1Q16558 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMB1Q16558 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMB1Q16558 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMB1Q16558 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KCNMB1Q16558 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMB1Q16558 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMB1Q16558 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMB1Q16558 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMB1Q16558 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMB1Q16558 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMB1Q16558 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMB1Q16558 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KCNMB1Q16558 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KCNMB1Q16558 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNMB1Q16558 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNMB1Q16558 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNMB1Q16558 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KCNMB1Q16558 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNMB1Q16558 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNMB1Q16558 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNMB1Q16558 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNMB1Q16558 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNMB1Q16558 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNMB1Q16558 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNMB1Q16558 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNMB1Q16558 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNMB1Q16558 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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KCNMB1Q16558 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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KCNMB1Q16558 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNMB1Q16558 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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