Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCD2Q16342 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDCD2Q16342 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCD2Q16342 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCD2Q16342 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCD2Q16342 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PDCD2Q16342 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCD2Q16342 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCD2Q16342 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCD2Q16342 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCD2Q16342 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PDCD2Q16342 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCD2Q16342 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDCD2Q16342 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCD2Q16342 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCD2Q16342 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCD2Q16342 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDCD2Q16342 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDCD2Q16342 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDCD2Q16342 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCD2Q16342 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCD2Q16342 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCD2Q16342 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCD2Q16342 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDCD2Q16342 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCD2Q16342 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDCD2Q16342 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCD2Q16342 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCD2Q16342 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCD2Q16342 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCD2Q16342 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCD2Q16342 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCD2Q16342 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCD2Q16342 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCD2Q16342 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCD2Q16342 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDCD2Q16342 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCD2Q16342 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCD2Q16342 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCD2Q16342 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCD2Q16342 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDCD2Q16342 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCD2Q16342 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCD2Q16342 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCD2Q16342 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDCD2Q16342 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCD2Q16342 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCD2Q16342 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCD2Q16342 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCD2Q16342 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCD2Q16342 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDCD2Q16342 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCD2Q16342 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCD2Q16342 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PDCD2Q16342 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCD2Q16342 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCD2Q16342 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PDCD2Q16342 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCD2Q16342 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCD2Q16342 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCD2Q16342 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCD2Q16342 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCD2Q16342 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PDCD2Q16342 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCD2Q16342 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCD2Q16342 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCD2Q16342 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCD2Q16342 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCD2Q16342 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PDCD2Q16342 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDCD2Q16342 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDCD2Q16342 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PDCD2Q16342 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCD2Q16342 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCD2Q16342 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCD2Q16342 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PDCD2Q16342 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCD2Q16342 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCD2Q16342 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PDCD2Q16342 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCD2Q16342 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCD2Q16342 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCD2Q16342 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCD2Q16342 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDCD2Q16342 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCD2Q16342 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCD2Q16342 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCD2Q16342 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCD2Q16342 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCD2Q16342 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDCD2Q16342 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCD2Q16342 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCD2Q16342 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCD2Q16342 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDCD2Q16342 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCD2Q16342 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCD2Q16342 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCD2Q16342 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCD2Q16342 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDCD2Q16342 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
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