Protein–RNA interactions for Protein: Q156A1

ATXN8, Ataxin-8, humanhuman

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Length 80 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8Q156A1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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ATXN8Q156A1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATXN8Q156A1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATXN8Q156A1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATXN8Q156A1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATXN8Q156A1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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ATXN8Q156A1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATXN8Q156A1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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ATXN8Q156A1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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ATXN8Q156A1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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ATXN8Q156A1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATXN8Q156A1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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ATXN8Q156A1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATXN8Q156A1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATXN8Q156A1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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ATXN8Q156A1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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ATXN8Q156A1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ATXN8Q156A1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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ATXN8Q156A1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ATXN8Q156A1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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ATXN8Q156A1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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ATXN8Q156A1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ATXN8Q156A1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATXN8Q156A1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ATXN8Q156A1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATXN8Q156A1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
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