Protein–RNA interactions for Protein: Q15345

LRRC41, Leucine-rich repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC41Q15345 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC41Q15345 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC41Q15345 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC41Q15345 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC41Q15345 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC41Q15345 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC41Q15345 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRRC41Q15345 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC41Q15345 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC41Q15345 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRRC41Q15345 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC41Q15345 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC41Q15345 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC41Q15345 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRRC41Q15345 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC41Q15345 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC41Q15345 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRRC41Q15345 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC41Q15345 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRRC41Q15345 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC41Q15345 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC41Q15345 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC41Q15345 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC41Q15345 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC41Q15345 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC41Q15345 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LRRC41Q15345 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC41Q15345 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC41Q15345 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC41Q15345 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LRRC41Q15345 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC41Q15345 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LRRC41Q15345 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC41Q15345 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC41Q15345 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC41Q15345 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LRRC41Q15345 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC41Q15345 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC41Q15345 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LRRC41Q15345 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC41Q15345 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LRRC41Q15345 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC41Q15345 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC41Q15345 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC41Q15345 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC41Q15345 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC41Q15345 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC41Q15345 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LRRC41Q15345 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC41Q15345 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC41Q15345 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC41Q15345 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LRRC41Q15345 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC41Q15345 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC41Q15345 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LRRC41Q15345 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC41Q15345 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC41Q15345 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LRRC41Q15345 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC41Q15345 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC41Q15345 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC41Q15345 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC41Q15345 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LRRC41Q15345 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC41Q15345 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC41Q15345 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC41Q15345 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LRRC41Q15345 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LRRC41Q15345 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LRRC41Q15345 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC41Q15345 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC41Q15345 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LRRC41Q15345 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC41Q15345 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC41Q15345 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC41Q15345 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC41Q15345 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
LRRC41Q15345 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC41Q15345 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC41Q15345 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC41Q15345 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC41Q15345 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC41Q15345 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
LRRC41Q15345 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC41Q15345 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC41Q15345 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC41Q15345 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC41Q15345 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC41Q15345 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC41Q15345 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC41Q15345 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC41Q15345 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
LRRC41Q15345 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC41Q15345 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC41Q15345 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC41Q15345 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC41Q15345 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
LRRC41Q15345 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LRRC41Q15345 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LRRC41Q15345 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 197.7 ms